而张文德的发迹主要在江南战役中。
咸丰三年（1853）元月，太平军第一次攻佔武昌。二月，分水陆两路，以破竹之势东下，於三月二十九日攻入南京城内，将南京改名為天京，定為太平天国的都城。此时，清廷任命向荣为钦差大臣，专办军务，驰援江南。一部分镇筸兵勇便跟随向荣，一路跟踪太平军到达南京城外，成为和春指挥的江南大营兵力的一部分，参加了攻克京峴山的战斗。
咸丰六年向荣卒于军后，和春为钦差大臣，督办江南军务，张国梁为湖南提督。咸丰七年，镇筸兵勇在张国梁指挥下，转战江南，攻克太平军精锐驻防的句容、溧水，十一月攻克被太平军佔领五年的军事重镇镇江。根据光绪《凤凰厅志》记载，因屡立战功，镇筸军将士张文德升任都司，田祖德升任参将，滕长林、林从太提为守备，张正全提为把总。
镇江位於南京下游七十公里，具有重要战略意义，镇江的得失直接关系到南京的安危。太平军为夺回镇江，从咸丰七年到同治二年（1863），向镇江发动了一次又一次的进攻。咸丰十年（1860），太平军大军围困镇江，张文德所部镇筸军从张国梁力援镇江，“扼水栅七昼夜”，多次打退太平军的攻坚，迫使其撤围而去。同治二年，太平军由丹阳进犯镇江，激战中，张文德“腹中炮肠出，裹创而战”，一直坚持到援军赶来，守住了阵地。从此张文德所部便协助冯子才坚守镇江，负责剿防镇江西南各路太平军。即使在清军江南大营被摧毁的最艰难的时局，太平军也未能将镇江攻克。
在历时数年的镇江保卫战中，张文德的功劳最为卓著，因此被提升为镇远镇总兵。同治二年，张文德击败太平军於镇江西南的牧马口、薛村、柏林；又击败由东路围攻镇江的太平军於博洛村，被加授提督衔。同治三年（1864），张文德所部又会同鲍超攻克丹阳。因镇江保卫战之功，张文德成记名提督，林从太“奉旨加提督衔”，文汉章由参将升为简用总兵，加提督衔。
同治六年至七年，张文德以镇远镇总兵“署贵州提督”。到了光绪元年（1875）张文德在威宁镇总兵任上，因剿古州苗民起义有功，“加头品顶戴，擢贵州提督”。
刘士奇等一批镇筸军将士却发迹于淮军。
咸丰八年（1858）九月，太平军击溃了包围天京的江北大营。咸丰十年五月，又 施调虎离山之计，彻底击溃了江南大营，致使清王朝在江南的绿营武装基本瓦解。太平军实施挺 进东南的战略，乘胜连下丹阳、常州，六月佔领苏州。此后又先后攻佔苏南及浙江嘉兴，克临安、余杭。于咸丰十一年底，佔领浙江省城杭州。此时，太平军在苏南、浙江几乎连成一片，上海已形同一座孤岛。為了解救江南危局，清廷在江南大营溃败后，只得授曾国藩以两江总督要职，担任钦差大臣，督办江南军务，在江南作战的镇筸军也就进入了曾国藩的麾下。
此时，清军兵员匮乏，曾国藩除扩张湘军外，又派李鸿章招募人马，组建淮军。同治元年（1862），李鸿章很快组建了最早的四营淮军。“曾国藩担心新建的淮军兵力太单薄，还从湘军各部调兵借将”。这样，刘士奇等一批镇筸军将士便进入了淮军的系列。刘士奇，凤凰水打田乡人。参加了攻克镇江、扬州、仪征等次作战，咸丰十年又参加了解围镇江的激战。因屡立战功，由士兵逐级升為游击。进入淮军系列后，于同治元年移防上海。参加了肃清上海週边太平军的战事。同年十一月，李鸿章发起苏常战役，刘士奇所部随刘铭传作战，攻克了常熟、太仓、昆山。刘士奇作战英勇，“迭带重伤，奏赏奋勇巴图鲁，加总兵衔，以副将补用”。同治二年，淮军攻克苏州后，刘士奇奉旨记名简放提督，成为统领一路的将领。同治三年，刘士奇领军参加了攻克渐江嘉兴和江苏常州的战斗，因军功卓著，授贵州古州镇总兵。到淮军派兵支援曾国荃加紧围攻南京之时，刘士奇已成为淮军炮队的统领。
同治八年到十年，刘士奇以古州镇总兵，“奉命署贵州提督”。
与刘士奇同样进入淮军系列作战的，还有滕长林、张正全、谭正武、张家瑜等一批镇竿军将士。他们在解围上海的虹桥、四江口等恶战中，在苏常战役中，以及在扫清浙江的战役中，均立下无数次战功。到攻克南京而江南平定之时，滕长林已加提督衔，张正全、谭正武、张家瑜均加总兵衔。
吴自发的跃升则源于贵州的平定。
咸丰五年，在太平天国革命运动的影响下，先后在贵州爆发了反清起义。此后逐步向全省其他地区蔓延，成了如火如荼之势，时间一直持续到同治十一年（1872）。由於清廷在贵州的兵力不足，防务空虚，於是多次徵调湘军、川军和滇军入黔作战，力图稳定贵州局势。咸丰五年十月，黔东北铜仁斋教首领徐廷杰组织斋教军，“攻陷铜仁”，“弥月连陷思州、思南、石阡、松桃、玉屏、青溪六府厅县”。十一月斋教军中的一支进入凤凰境内，由新场、拉毫、菖蒲塘一线，“迭犯厅城”。驻凤凰的辰沅道官员一方面急调协守省城的一支镇筸军兼程回防凤凰，另一方面号召乡绅出钱，临时招募乡勇以捍卫凤境。
得胜营苗举人吴自烈迅速组成了一支由苗族子弟组成的乡勇队伍，他的族弟吴自发也就成了他的助手。乡勇、屯丁、练勇紧密配合营兵，奋力反击铜仁教军，“三战皆捷，穷追出境”。值原调防长沙的镇筸军田宗藩部一千五百人撤回凤凰，进而收复了被教军佔领的麻阳、晃州，并越过省界收复了松桃。咸丰六年春、镇筸兵勇屯丁师出亭子关，直下铜仁，“屡战灭其精锐，克复铜城”。到十二月，徐廷杰教军失败，黔东北平定。吴自烈升任为西路军统领，因其己年过五旬，便将兵权交给了吴自发。
吴自发是与吴自烈之子吴朝凤一同入伍，在自烈的指挥下，与教军鏖战，时年23岁。咸丰六年（1856年）九月，镇竿之兵在黔东北对教军进行全面扫荡，自烈自发从左翼进攻路溪一带。咸丰七年（1857年）三月，黔东北基本安靖。湖南巡抚骆秉章，奏请朝廷根据援黔战功，奖励随军官兵，授吴自烈为西路军统领，继续进剿教军残部。但自烈原为一介书生，又已年过五旬，不惯军旅生涯，加之其子朝凤受重伤，遂将所部交自发统领，自己则回居故里。自发时年二十三岁，便统率二千八百乡勇，进剿黔东。
吴自发带领这一镇筸乡勇部队，奉命向南开拔，参加清军征剿，驻守天柱县。同治三年，吴自发升任镇远知府，六年提升为贵东兵备道道台。