正大营、盘石营和松桃厅被苗民围攻了二十余天，各城都被攻破过，直到福康安、和琳率领清军主力会剿时，起义军才被迫撤出阵地。
而和琳到秀山后，即与孙士毅会同提镇，由石耶场、贵道溪等处分投剿捕，擒杀多名…而山坳岩洞间，随在均有起义军屯聚。和琳连日与孙士毅及提镇诸臣，带领将备，复由后路龙团坝、得胜坪、邑梅、邑农一路通往楚黔处所，亲加侦查，均系大山层叠，路遥歧多。于是分拨干练备弃，添兵住扎，互为声援，务令严密堵截，并将各溢口乡男人夫．遍加奖赏。每名按日酌给口粮，令其实力守御，毋许疏懈。
随着福康安、和琳率领清军主力从西南、西北两个方向向铜仁、松桃起义军压过来, 黔东苗民开始从主动走向了十分被动的局面，对正大营、盘石营和松桃厅三个据点从主动围攻变为被动的阻击。
福康安率领安龙镇总兵花连布大军，汇合先期到达的贵州提督彭廷栋，镇远镇总兵珠隆阿由铜仁向正大营、盘石营扑过来，迎击他们的是吴添半，吴添半抵挡不住，正要退兵，恰好吴庭礼、吴廷义兄弟奉吴八月之命率领凤凰、乾州两厅的援兵赶来，于是在正大营、盘坨、兰草坪一带与清兵展开了决战，双方伤亡都十分惨重。福康安见正大营一线难以取得突破，便将主力从铜仁西北转向松桃厅城。
围住松桃厅城的是石柳邓部，急忙迎击敌人。而吴添半、石三保、吴庭礼兄弟此时先后撤出了黔东战场，在湘黔两省交界的腊尔山、来龙山一带的苗寨修筑工事，准备持久战。
清乾隆平定苗疆图三：《攻解松桃之围》
最终解松桃之围的清军主将是花连布，花连布武艺高强，善于用兵，俗称“花老虎”，加上清军人多势众，武器精良，在这种不利地形中石柳邓很难抵御得住。只得从松桃厅城一带撤回松江河北。松桃厅都司孙清元原来被围在云落屯山顶，见苗军后面冒起烟来，料是援兵来到，便从云落屯杀出来，敌兵内外夹攻，义军伤亡惨重，孙清元赶到松桃厅迎接花连布的到来。至此，清军解了松桃、盘石营、正大营之围。
松桃的战斗在这里基本结束，双方的主战场转移到了永绥、凤凰和乾州，
我苗子来告状还要规矩钱八千八百否？—永绥之战
福康安、和琳血洗黔东后，便将进攻的矛头直接指向腊尔山苗疆腹地，而永绥靠近黔东，首当其中。
此时湖广总督福宁、湖南提督刘君辅为镇筸苗军所阻，动弹不得。福康安还是命令刘君辅协助进剿永绥苗军。
刘君辅接令后知道从凤凰、乾州去不了，便带领八百清军悄悄绕道辰州，再由永顺府南下，与湖北宜昌总兵张廷延汇合，由北向永绥厅发起攻击。至此，北有刘君辅、张廷延，西有和琳、穆克登阿，南有福康安、额勒登保、德楞泰和花连布等，永绥苗族起义军面临着三面包围的形势。
在永绥，与清兵作战的主要是石三保部，从松桃退下来的石柳邓部以及从乾州赶过来的吴庭礼兄弟一起配合。
四月，石三保、石柳邓与福康安在葫芦汛展开着大战，刘君辅由永顺府南下，直逼花园（今花垣县城）。花园一带的义军毁掉酉水浮桥，以阻止清军南下，刘君辅结筏横渡酉水，攻下了花园，令张廷延守之。其后刘君辅挥师深入苗疆腹地，直取龙团（今花垣龙潭镇），攻破土孔，又令副将富志那去解永绥厅城之围。
石三保见刘君辅长驱直入，决意分兵与其决战。于是留下石柳邓、吴庭礼兄弟、陇老二等战将凭借有利地形与所筑石城、木栅栏阻击福康安东进，自己与手下心腹陇伍勒、石老岩等率主力北进，首先打败富志那，围住了永绥厅城。《永绥厅志》记载，“当逆苗困永绥时，群跃登山头，以刀指向城中呼之曰：‘问你太爷们，我苗子来告状还要规矩钱八千八百否？”义军还用钢锉铲平潮水溪旁象征封建统治的摩崖铭。
富志那自己知道无力抵御，恐厅城有失，急派手下突围向刘君辅求援。刘君辅见厅城危急，急忙带兵增援永绥厅城，行至滚牛坡，遭到石三保伏击，伤亡惨重，不得不折回龙团堡，谁知石三保反而追着刘君辅不放，一路追杀，等刘君辅回到龙团堡，石三保率领一万余义军已经把龙团团团围住。
龙团位于永绥厅城西北部，是一片开阔的平坝，但西有太阳岭，南有玉屏山，玉屏山下还有一个龙门寨，龙团在龙门寨后，是一个易守难攻的地方。石三保围住龙团后多次发起攻击，刘君辅躲在龙团堡中不敢出来，石三保抢占太阳岭和玉屏山，由龙门寨、板档寨、古老寨三路进攻龙团堡，刘君辅见情况危急，派其长子左营守备刘瑞突围向福康安求援，福康安急忙派花连布给刘君辅解了围。可石柳邓和陇老二得知花连布去支援刘君辅，调集苗兵数千，突然将福康安围在榔木陀山梁，福康安慌了神，下令花连布立即回营，并大骂刘君辅无能。
清乾隆平定苗疆图四：解永绥城围
图说：三月，福安康与和琳会合一处，齐至湖南。三月十八日过松桃河，攻下石花寨，沿途劫杀苗民，力解永绥城之围。苗民与清军激战三日，主动放弃了对永绥的包围，撤兵据守苗寨。其中聚集苗民数千人的土空寨等苗寨遭到清军残酷杀戮。画面场景开阔，远处是已得到解围的永绥城全景，城门洞开，旌旗飘扬。城门前官兵列队欢迎援助的清军到来。图右方中景是清军持续攻打苗寨的情景，火器并用，木栅纷纷倒下，苗民不堪一击倒地。图左近景清军骑兵赶上了一群手持木棍的苗民，欲以箭射之，一人跪地投降。