《山海经》记载了包括内科、外科、五官科及预防医学的50余种疾病的症状，有的被后世中医典籍所采纳。如疠、痈、疸、瘕、痔、癣、痿、蛊、疟、瘿等，已成为中医学的专用术语。世界医学现已规定，“痔”这个词为肛肠病之一的痔疮的名称。汉代许慎的《说文解字》中释瘿为“颈瘤也”。即我们今天所说的甲状腺肿大。释疫为“发皆疾也”，指种类之间的传染病。释疠为“恶疾也”，专指今天的麻风病，这些都反映了传统文化与中医的渊源关系。
晋代的郭璞认为巫“皆神医也”。在医药启蒙的上古时期，巫与医是集于一身的。《山海经?海内西经》载：“开明东，有巫彭、巫抵、巫阳、巫履、丕凡、丕相……皆操不死之药而距之”。唐代诗人李贺《浩歌》中写道“彭祖巫咸几回死”，巫咸指的是商朝名巫咸彭。《山海经?大荒西经》上说，咸彭往来灵山采百药，以祛疾疗灾。说明巫医混杂，正是早期医药启蒙阶段多元的历史特点。《黄帝内经》诞生，标志着巫医两者的解体，中医药学已具备了独立分科的必然。但近年来，随着认识的深化，人们对“祝由”有了新的见解，认为其中包含着心理的治疗，也有情志调摄和气功导引的科学成分。
针灸学是中华民族对世界医学独特的创造与贡献。针灸的起源很早，是从砭石疗法的基础上发展而来的。《山海经?东山经》说：“高氏之山……其下多箴石。”所谓箴石，不仅是原始的外科医疗工具，也是我国针灸术的萌芽。从石砭、骨针、竹针到青铜及铁针，针灸工具的进化反映着生产力发展的水平。值得一提的是，《大荒北经》还记载了气功疗法。说：“继天民，任姓。无骨子，食气，鱼。”文中所说的食气，指的就是气功导引，与后世的“辟谷”应当有渊源关系。
古人的寿命
《山海经》中记载了一些寿命很长的人，其中有“轩辕之国在此穷山之际，其不寿者八百风。……白民之国在龙鱼北，白身被发。有乘黄，其状如狐，其背上有角，乘之寿二千岁。”
另外，许多最古老的记载显示，远古时帝王的寿命都很长久。
《帝王世纪辑存》：“黄帝在位百年而崩，年百一十岁矣，或传以为仙，或言寿三百岁。”“少昊在位八十四年而崩。”“颛顼在位七十八年，年九十八岁。”“帝喾在位七十五年，年一百五岁而崩。……子帝挚立，在位九年。”“帝尧即位九十八年，年百一十八岁。”“舜百岁癸卯崩。或云舜年一百五岁，亦云一百一十二岁。”
《通鉴外纪?黄帝》：“黄帝崩，葬桥山。”原注：“在位一百年，或云一百一十年。或传以为仙，或言寿三百岁。”《通鉴外纪?帝尧》：“尧辟位二十八年，凡在位百年而崩，舜即天子位。”《通鉴外纪?帝舜》：“帝舜在位三十三载，命禹摄行天子事。”“禹摄政十七年，舜在位五十载。”原注：“舜为天子五十年，凡寿百一十二岁。或云舜年一百五岁，亦云一百一十三岁。”
《纬书集成?春秋命历序》：“黄帝一曰帝轩辕，传十世，二千五百二十岁。”
《命历序》曰：“黄帝传十世，一千五百二十岁。或云十八代。”“少昊在位八十四年，崩。年一百岁，或云在位百年，葬云阳。《命历序》曰少昊传八世、五百年，或云十四世，四百年。”“颛顼在位七十八年崩。年九十八岁，或云九十一岁，葬濮阳。”“颛顼传九世，三百五十年，或云八世五百四十八年。”“喾在位七十五年崩，或云六十三年，年一百或云一百五岁，九十八岁，九十二岁，葬宜阳，或云濮阳。”“喾传十世，四百年。”
孔子的弟子宰予问于孔子曰：“昔者闻诸荣伊，言黄帝三百岁。请问黄帝者人邪，抑非人邪？何以至于三百年乎？孔子曰：‘生而民得其利百年，死而民畏其神百年，亡而民用其教百年，故曰三百年’。”
《圣经》上记载，在大洪水前人的寿命能达近千岁。其中亚当930岁、挪士撒拉969、风雅列962岁、挪亚950岁。苏美尔文明记录的远古时期人类的寿命更是长得令人难以想象。
距离之谜
《山海经》中关于距离的数据前后矛盾，不符合实际情况，让人无法理解。按其描述，两座大山之间的距离远的有三五百里，近的只有几十里。按这种描述，大地上应该布满了奇特的山脉。而我们知道，昆仑山脉长约2 500公里，宽300公里，太行山绵延了近400公里。一个普通的大山，其方圆也得有百里。
禹曰：天下名山，经五千三百七十山，六万四千五十六里，居地也。言其五臧，盖其余小山甚众，不足记云。天地之东西二万八千里，南北二万六千里，出水之山者八千里，受水者八千里，出铜之山四百六十七，出铁之山三千六百九十。（《中山经》）
帝命竖亥步，自东极至于西极，五亿十选九千八百步。竖亥右手把算，左手指青丘北。一曰禹令竖亥。一曰五亿十万九千八百步。（《海外东经》）
《山海经》中提出了几个重要的数据：天地之东西二万八千里，南北二万六千里和自东极至于西极，五亿十万九千八百步。
依此数据，当时是足可以确定地球的形状的，但《山海经》描述的陆地的整体却是平的。这倒是符合“天圆地方”的说法。
如果硬把二万八千里和二万六千里说成是地球的赤道和南北两极直径的话，那五亿十万九千八百步又指的是什么？就算每步是半米，那就是二十五万公里。这么大的距离不是当时地球人可以理解的。
《山海经》中的世界地理
很多观点认为《山海经》是记录古代中国的地理，也有一些观点认为《山海经》是记录古代世界的地理。但《山海经》中描述的大多山脉是无法和现实对应上的。这是为什么呢？
美国学者墨兹博士研究了《山海经》，根据经上所说《东山经》在中国大海之东日出之处，她在北美按经考察，经过几次失败，她一英里一英里地依经上记述的山系走向，河流所出和流向，山与山间的距离考察，结果成功了。查验出美国中间和西部的落基山脉、内华达山脉、喀斯喀特山脉、海岸山脉的太平洋沿岸与《东山经》记载的四条山系走向﹑山峰﹑河流走向﹑动植物﹑山与山的距离完全吻合……墨兹历经艰难险阻，踏勘的结果是：
第一列山脉，起自今美国怀俄明州，至得克萨斯的格兰德河上，共12座山。将古华里换算为英里，与《东山经》中第一列山的距离完全相符。
第二列山脉，起于加拿大的曼尼托巴的温尼泊，止于墨西哥的马萨特兰，共17座山。距离与《东山经》第二列山脉相合。
第三列山脉是沿海岸山脉的太平洋沿岸，完全走太平洋海岸航行，起于阿拉斯加的怀尔沃德山，至加州的圣巴巴拉，共9座山。距离也与《东山经》所列第三条山脉相符。
第四列山脉，起于华盛顿州的雷尼尔火山，经俄勒冈州到内华达州北部，共8座山，距离与《东山经》第四列山相合。
远古神仙
伏羲、女娲
伏羲，中华民族人文始祖，是我国古籍中记载的最早的王之一，相传其人首蛇身，与其妹女娲成婚，生儿育女，成为人类的始祖。在发现的最古老的壁画或其他画像中，伏羲、女娲都被描绘成人首蛇身的样子。
《海外西经》记载，轩辕之国在（此）穷山之际，其不寿者八百岁。在女子国北。人面蛇身，尾交首上。