结果，张九六的队伍一下子就被冲乱了。他眼见形势不利，便只好退走，可是他在半路上竟又遇上了埋伏，马也尥了蹶子，最终他被徐同志麾下的先锋刁国宝、王虎子所俘获，另外其部将张、汤二将军也一并被擒。
话说朱老大也一向知道这个张九六枭鸷有谋，是个难得的将才。老张攻陷诸郡，九六出力最多。所以，自他被擒以后，张九四的气量也顿时短下来了好几分。朱老大想要留着张九六以引诱老张，没想到这个张九六竟很有骨气，他大概也是咽不下这口被人拿住的恶气。在被羁押期间，冲动之下，他竟还命人偷偷地送信给哥哥，让哥哥投降元朝，以合兵来诛灭朱同志。
消息很快就走漏了，朱老大见他如此死硬，怕哪天他再想法溜了，于是为绝后患，竟把他干脆给杀了。真是“一失足成千古恨，再回首是百年身”，这能征善战的九六一死，也就等于剪除了老张的羽翼，对他的实力和士气自然影响很大。当然，此举也严重影响了朱、张的双方关系。
果然，在这年的八月（1356），张士诚部元帅江通海来降。
针对于陈保二等降将复叛的问题，也引起了朱老大的思考和重视，他认为诸将不能一视同仁正是导致这一恶果的主要原因。于是他便传谕道：“陈保二之所以复叛，全是因为诸将不约束手下的士卒，以至他们向陈保二肆意勒索，乃致怨而叛。”以后诸将应该严格约束部下，并且再不许以另眼看待降兵降将。
再加上常州久攻不下，于是朱老大怒了，他命“自徐达以下，皆降一官”。接着，他又写了书信批评徐同志等人道：“虐降致叛，老（劳）师无功，这正是咱批评你等的因由；今后，你等要更加勉力用心，反思己过，以求将功赎罪才好。否则，必罚无赦！”
这年的九月，朱老大驾临镇江的江淮府。他先是入城拜谒了一下孔子庙，又分遣儒士们告谕各乡邑，以劝耕桑、筑城开堑，这正是休养民力、加强守备的道理；又命总管徐忠设置了金山水寨，以阻遏南北寇兵。不久，他就回到了应天。
其实像拜孔、尊儒之类的举动，全是朱同志拉拢士子们的用心所在。而收买士子之心这一问题倒是值得注意的，因为作为读书人而言，他们往往是一个家族、一个聚落甚至一个集团的主脑，有学问的人也总是受人尊敬，或者是大家出身；只要能够笼络住了他们，也就等于把其家族、聚落或集团都给笼络住了。
这年的十月，常遇春同志被晋升为管军总管，不久又被晋升为了统军大元帅，成了未来独当一面的人物。
① 兵家自来就有关于正兵、奇兵的配合使用问题，被使用在明处或者主力部队的就可以叫做“正兵”，反之就叫做“奇兵”。兵家一贯倡导“以正合，以奇胜”；不过正、奇之间也可以互相转化，就像唐朝名将李靖在唐太宗面前批评自己的舅舅韩擒虎的话：“我舅舅只知道正兵是正兵，奇兵是奇兵，却不晓得它们可以互相转换的道理”（《唐李问对》）。
常州既被围，张九六又挂了，张九四显然是怕了。
他派遣部下孙君寿带着书信来请和，此文书整得是冠冕堂皇，肯定是下面文人帮着策划的，其中追溯自己的革命史道：“俺兄弟们开始的时候，小心地潜伏在淮东一带，对于草野生活已经很满足了。偏巧这时元朝的政治紊乱，民心思乱，俺兄弟也就自泰州起兵，不久又取了高邮，向东一直扩地至大海。那靼子的官员、将帅们，都一齐来攻俺兄弟，自然是他们想自取灭亡，俺兄弟于是杀了平章实理门、参政赵伯器等人，这样也就和元朝结下了深仇（其实咱们本是一条战线上的嘛）。元廷派人来招安，俺兄弟也没搭理。今春上俺兄弟既占了姑苏，想着若无名号就不能服众，因此俺才苟且称了王，这实在是时势所使然啊……”（白话翻译）
接着，老张又开始吹捧起朱同志来：“早就听说您贤明，您以神武之资，起兵淮右，而今又占据了这帝王之都的金陵，这真是英雄用武的好地方啊，俺在这里向您恭贺了啊！先前俺既拿住了你部的詹、李二将，照顾不周，到现在还没把行李给他们准备好，是俺兄弟的疏忽！您上回遣使来通好，都是俺兄弟一时鬼迷了心窍……眼下常州这个事，当然怪不得别人，都是俺兄弟自己作下的，俺有罪，俺该死，俺反省！如果您大人大量，愿意就此与俺兄弟和解，那么少不得孝敬的：每年可以输粮二十万石、黄金五百两、白金三百斤，以作为您犒赏兵士的资财。从今往后，咱们各守本土，再不冒犯，俺在这里先谢过了！”
吴王夫差因一时心软而导致了何样的结果？国破家亡！这个教训何其惨痛。他张九四就是今日的越王勾践，而朱同志绝不能成了夫差。再说这老张不过缓兵之计，勾践复国尚需二十年时间，可他张九四却随时都可以反咬一口。
养虎遗患的傻事干不得，所以朱同志一面在书信中谴责了老张一番，一面提出了苛刻的条件：他把粮食的数额提高到了五十万石，还说“你那里应当好好想一想，咱大丈夫做事，自当以一颗赤心相待，你老兄净整这些华而不实的浮言夸语，说句你不爱听的话吧，其实咱很讨厌这个！”
老张在看过朱同志的回信后，蔫了，怒了，这姓朱的太会磕碜人了！所以，他就不再打求和的主意了，咱们就继续顶牛吧。
这年的十一月，徐同志仍然在率部围困着常州，为了能尽快啃下这块骨头，朱老大又抽兵两万驰援常州。
也就在这个时候，意外的事情发生了：朱部的元帅郑佥院在张士诚守将的引诱下，居然带着他的七千长兴新附义兵投敌了。
本来，朱家军已经形成了四面围攻常州的局面，这郑佥院一投敌，四面也就被去掉了一面。当时徐达驻守在城南，常遇春扎营于城东南三十里外。城内张家军伙同郑佥院带兵前往偷袭徐达、汤和的营垒，徐同志从容应敌，军队并未出现慌乱；接着，常遇春、廖永安、胡大海等率部来援，内外夹击，将敌人打得大败而回。龟缩进城，再也不敢出来了。
对此，老张当然不能坐视不管，他又派出了自己的手下大将吕珍率小股部队偷偷驰入常州，以督兵拒守。徐同志等也只得加强围困，以期把敌人活活困死在常州。
十二月，将江淮府改称为镇江府。宁国路（在今皖南）长枪元帅宁国玺率部寇掠广兴府，元帅邓愈击败之，并擒获了其总管武世荣，获兵千余人。
次年（1357）二月，朱老大派遣耿炳文、刘成自广德发兵攻取长兴（位于浙江最北端），张士诚部将赵打虎以兵三千迎战，败之，赵打虎出逃到了湖州。随即，长兴被攻克，并缴获了战船三百余艘，擒拿了守将李福安等人，另有万户蒋毅率所部二百人投降。
三月，改长兴州为长安州，立永兴翼元帅府，以耿炳文为总兵都元帅、刘成为左副元帅、李景元为右副元帅，守之。有个名叫温祥卿的儒士当时正避乱于长兴一带，他见朱家军还算靠谱儿，于是就携带着家眷来投奔耿炳文。小耿与这儒士交谈了一番，发现此人居然是个颇知兵事的奇人，于是便把他留在了营中参赞军事。温先生指示耿炳文要如何分兵把住要害之地，又如何修设战具以备将来守城之用，结果小耿无不一一采纳。
终于，常州城里的张家军撑不住了。先前，常州兵虽少，而粮食足，故坚拒不下。等到他们将一干叛军招引到城里时，反而竟成了累赘。军众粮少，不能自存，外加朱家军攻之益急，吕珍见大势已去，只得乘夜逃走。随后，常州便被徐同志等攻克了。