一是试图重新启用逆案名单中人。吏部尚书王光永在会推天津巡抚人选时，故意把列入逆案名单中的王之臣排在候选人的首位。御史田惟嘉上疏推荐逆案中人杨维垣、贾继春，政通使章光岳推荐逆案中人霍维华、徐杨光等人。
二是另立一个针对东林党人的逆案，对冲之前的逆案。
这两个方面的努力最终都归于失败，原因是：
在人事上，崇祯皇帝不可能拉屎往回坐，他是无论如何也不会同意把自己钦定的逆案翻过来的。刚刚入阁不久的周延儒揣摸圣意，也反对起用逆案中人，当崇祯皇帝拿着王光永的候选人名单征求他的意见时，他说道：“如果王之臣能起用，那么逆案中的人都可以起用，而魏忠贤和崔呈秀也可以平反昭雪了。”听了周延儒的话，崇祯更加坚定了决心，无论如何也不会打开起用逆案中人的口子。
在另立逆案上，“阉党”人员计划从兵部发难，但是兵部尚书梁廷栋关键时候反悔，不敢造次，使得计划中途夭折。
终崇祯一朝，翻案和反翻案的斗争一直没有停息，这造成了两个方面的后果：
一方面导致崇祯朝人才缺乏，既使在最缺乏人才的时候，崇祯也决不启用逆案中人，他频繁起用新人，结果交了大量学费；
另一方面，由于内讧始终存在，群臣不能齐心协力共赴时艰，这是明朝灭亡的重要原因，南明建立以后，两股势力仍旧“纠缠不己”，“日费提防”，最终鹬蚌相争，渔翁得利，满清消灭了南明政权，明朝失去了挽救民族危亡，保持半壁江山的最后机会。
虽然崇祯没有因为东林党人捅了篓子就给阉党好脸看，但是他扇东林党的耳光却是实实在在的。
崇祯二年十二月，己巳事变发生后，周延儒、何如宠、钱象坤入阁，不久，韩鑛、李标等东林党阁臣相继离职，六月，温体仁、吴宗达入阁，不久，东林党首辅成基命离职，周延儒递进为首辅。
从这些人事变动可以看出，无党派新兴力量正迅速取代东林党掌握最高权力，这表明经过己巳事变的洗礼，崇祯对东林党的态度悄然巨变。
四、周延儒早节不保
虽然温体仁和周延儒一起对付过东林党，并在崇祯对东林党产生疑虑的背景下入阁，但是两人在人品心事方面，在对待东林党的态度上并不完全一样。
周延儒没有政治立场，是一个政治投机分子和利己主义者，为人机警善变，擅于揣摩圣意，见风使舵。
他早年在党争中左右逢源，既与东林党人交好（始延儒里居，颇从东林游，善姚希孟、罗喻义），又与“阉党”重要成员冯铨关系密切（与同年生冯铨友善）。
在会推事件中，周延儒得罪了东林党（既陷钱谦益，遂仇东林），于是东林党人误认为他与亲阉党的温体仁是一伙的。
所以，当崇祯二年三月崇祯帝单独召见周延儒长谈后，东林人士异常惶恐，纷纷对其发起攻击。
这的确是对周延儒的误解，会推风波只是一次偶然事件，他并非出于反对东林党才与温体仁联合攻击钱谦益，他与钱谦益是个人恩怨，由于钱谦益暗中损害了他的利益，他才不得不与其斗争。对他来说，没有永久的朋友，只有永久的利益，一切都从个人利益出发，为了实现利益最大化，结党不是问题，东林党也不是问题，他并非不在乎正邪忠奸，但是他对正邪忠奸的态度，要服从他个人的利益。
因此当东林群臣对周延儒发起攻击时，他发出这样的感叹：“诸臣说的都是莫须有的事，指责我的事无非是‘想当大官’‘为阉党翻案’，这实在是防我太深，太小看我了。希望不要杯弓蛇影，庸人自扰了”。意思是要撇清自己与阉党的关系，告诉东林党人：我不是阉党一伙的，你们咬错人了！
温体仁就不同了，他虽然以无党派孤臣的面目出现，但事实上他的政治立场是反对东林党的，因此在钱谦益案和己巳事变中，他才勇敢地站出来挑战庞大的东林党利益集团，他是东林的政敌。
两个人差异巨大，又都不是省油的灯，很快就渐行渐远，并产生了矛盾。
进入内阁后，周延儒为了固巩自己的地位，主动修补了与东林党人关系，并着手建立自己的关系网（门户）。
建立门户，网罗门徒的一个快捷方式是主持会试，主试能决定一个考生的命运，明代没有标准化试题，也没有机器阅卷，作文的主观性很强，同一篇文章，说好有一千个理由，说不好也有一千个理由，能否中进士，全凭主考官的大眼一瞟，大笔一挥。
所以那些新科进士必须对主试感恩戴德，视之如再生父母，他们称主考官为座主，他们都是主考官的门生，在一次会试中得中进士的人称为同年，他们很容易成为一派，因为他们都有一个共同的再生父母（座主）。
因此，通过主持会试，可以将天下名儒网罗到自己的门下，扩大自己的势力，周延儒这样的无党派高官只有权没有势，因此他迫切需要主试一次会试，购入一大批潜力股，做一次长线。
然而按照惯例，内阁首辅政务繁忙，主试一事应该交由次辅担任，崇祯四年春举行会试之时，次辅是温体仁，理应由温体仁主持会试。
但是急于扩大门户的周延儒越俎代疱，剥夺了温体仁的主试资格，亲自出任主试，引起了温体仁的不满。
事实上，周延儒之所以如此不要脸，还不完全出于培植自己势力的考虑，他还要对这次会试进行操作，实现诸多即定的目标。
周延儒的亲戚（连襟）陈于泰，老友吴禹玉之子吴伟业（一代名儒，与钱谦益、龚鼎孳并称"江左三大家"，是娄东诗派开创者）都将参加这次会试。他们都是周延儒要确保实现的目标。在周延儒的操作下，陈于泰廷对第一，而吴伟业则高中会元。
值得一提的是，复社的创始人兼党主席张溥也参加了这次会试并得中进士。
复社是东林党的分支，在东林被取缔后继承了东林的事业，势力极其庞大，复社成员，抗清志士夏允彝评论：“时又有复社之名，与东林继起，而其徒弥盛，文采足以动一时，虽朝论苛及之，不能止也。”
张溥是顾宪成式的人物，而吴伟业又是复社的重要成员，他们都在周延儒主试的会试中脱颖而出，周延儒在次此会试中有提携东林的嫌疑。
结合己巳事变时，周延儒反对起用逆案中人王之臣一事，有理由相信，此时的周延儒己经倒向东林。
正是因为这个原因，温体仁和周延儒才彻底的貌合神离，并开始在暗中交手。
应该说周延儒毕竟还是年轻，仕途上过于顺利，缺少失败的教训，当上首辅后，以为有皇帝宠着，东林撑着，就无所忌惮，在为自己谋利益的道路上，胆子太大了一点，步子迈得太快了一点，以至于在自己的屁股上留下了不少的污迹。
周延儒任用私人，卖官鬻爵，所提拔的大同巡抚张廷拱、登莱巡抚孙元化，都是他的亲信，并从他们那里收受了大量的贿赂。
他的哥哥周素儒冒籍于锦衣卫千户，连他家的奴仆周文郁也都成了副总兵，他的家人纵横乡里，占尽江南美田良宅，激起了民变。
周延儒在工作上除了迎合毫无建树，在生活上快速腐化堕落，引起了舆论的抨击，朝臣们在私下谈起周延儒的时候，都恶心得想吐，对他的弹劾时有发生。
正在这时山东发生了孔有德叛乱，周延儒所提拔的心腹孙元化在处理叛乱时表现极其低能，把山东局面搞得一团糟，这引爆了人们对周延儒的不满。
崇祯四年十一月，言官们掀起了一个弹劾周延儒的高丨潮丨，言官们把周延儒批成一个“卑污奸险的小人”，周延儒的人则纷纷上疏申救，控辩双方展开了一场激烈的口水战。
在这场战役中，温体仁一直在暗中使劲，希望能一举扳倒周延儒。温体仁手里的资源是吏部，吏部尚书闵洪学是温体仁一手提拔的心腹干将，唯温体仁马首是瞻。