反省侵略战争
正确对待历史，是战后日本历届首相必须正视的重大问题。在这方面，作为社会党首相的村山富市，确实有一些新变化并受到周边国家的好评。
村山的变化首先从访问东南亚国家开始体现。
1994年8月23日开始，村山首相启程对菲律宾、越南、马来西亚和新加坡等东南亚四国进行为期一周的正式访问。此次出访的目的，是以经济援助为中心，密切日本与东盟各国的伙伴关系。每到一国，村山都要重申日本作为亚洲的一名成员，重视亚洲、重视与亚洲各国进一步发展互相依存、广泛合作的关系；表示日本要正视历史，同时推动亚洲各国人民特别是青年人之间的交流，加强与亚洲各国之间的相互了解，防止过去的历史重演。
如何对待历史认识问题，村山访问之前曾与外务省发生了一些矛盾。他决定访问新加坡时，到日本占领时期死难人民纪念碑去参拜。外务省次官闻讯后，特意来到首相官邸说：“听说您要参拜纪念碑，非常不好意思跟您说，请取消这个计划。”村山问“为什么？”次官回答说：“以前的日本总理没有人去过那个地方。”言外之意是，如果这次村山去参拜纪念碑，以后到访的首相都得去。这样的话，对战争时代的历史观就需要进行调整。但村山不为所动，坚持前往纪念碑悼念，受到新加坡政府的高度评价。
中国是受日本军国主义侵略时间最长，祸害最深重的国家。田中角荣访华以来，历届访问中国的日本首相都对过去的那段不幸历史，一再作出程度不等的反省。相比较而言，村山的反省更深刻更直接。
1995年5月2日到6日，村山访问中国。在与中国领导人的会谈中，村山表示：“日本的侵略行为和殖民统治，给中国及其他亚洲国家带来了灾难，对此日本表示深刻的反省。日本愿以二战结束50周年作为新的起点，决心走和平发展的道路，决不当军事大国，并以日中联合声明及和平友好条约为基础，同中国建立长期稳定的友好关系。”
5月3日下午，村山首相在向人民英雄纪念碑敬献花圈之后，驱车直奔卢沟桥，参观中国人民抗日战争纪念馆。这是日本首相首次来此参观。在展馆内，村山对随行的日本记者发表感想：“在战后50年之际，我来到了曾经给中国人民造成重大损失的战争象征地之一卢沟桥，使我又想起了过去，更加坚定了和平的决心。”
参观结束时，村山在纪念馆的留言簿上留言：“正视历史，祈中日友好、永久和平”。
显而易见，村山出访东南亚和中国的主要目的之一，是借二战结束50周年之机，一劳永逸地为历史问题划上一个句号。因此，村山在新加坡、中国访问时，做出了一些前任首相们未做过的举动，并受到被访问国领导人乐观或谨慎的欢迎。
但是，在日本国内，总有一些人生怕承认侵略会给自己留下一条不光彩的尾巴，于是在“非战决议”问题上无端生事。
日本国会关于二战结束50年的决议，即所谓“非战决议”，从1991年就开始酝酿。当时社会党和公明党倡议以太平洋战争50年为契机，发表国会的“非战决议”。三年后，1994年村山政权成立时，联合三党老话重提。
对社会党来说，“反战与和平”是立党的基础，通过“非战决议”可以说是理所当然。在这一点上，社会党左右两派立场一致。村山说：“这个问题涉及联合政权本身的存在价值。虽然遇到各种抵制，但如果不能实现的话，我当首相就没有意义。”他积极地要求在决议中明确写入“对侵略行为和殖民统治表示反省谢罪”。
联合执政的政党中，自民党对这一问题的态度非常消极。由两百多名自民党议员组成的所谓“终战50周年国会议员联盟”，反对国会通过“非战决议”。会长奥野诚亮曾因否认侵略历史而被迫辞去国土厅长官之职，并一直对此耿耿于怀。奥野说：“非战决议会留下历史祸根”，特别反对在决议中采用社会党提出的“谢罪”和“非战”等用词，说：“战争不仅是日本一个国家的错误”，“我们不是在战后50年间一直道歉了吗？非战是要放弃自卫队吗？”寻找各种理由，拼命阻挠。
在这种情况下，各执政党以“战后50周年问题计划小组”为中心，分历史问题、反省过去、对牺牲者表示哀悼、发誓维护和平等四个问题进行讨论。最后，在村山首相的坚持下，在1995年6月6日达成“表示深刻反省”的表述：
6月9日，日本众议院举行全体会议，审议表决执政党提出的战后50周年国会决议草案。表决结果，多数议员赞同，通过了《以历史为教训重下决心走向和平的决议》，即通称的“非战决议”。，
“非战决议”全文如下：
本院值此战后50年之际，对全世界的战死者及因战争而牺牲者，致以追悼之意。
而且，本院在对世界近代史上许许多多殖民统治和侵略行为进行回顾时，认识到我国过去进行过的这种行为及给予他国人民特别是亚洲各国人民带来的痛苦，对之表示深刻反省。
我们必须超越关于过去战争的不同历史观，谦虚地吸收历史教训，并建立和平的国际社会。
本院在此表明：决心在日本国宪法所揭示的持久和平的观念之下，与世界各国携手开创人类共同的未来。
特此决议。
显然，这与村山多次作出的表述有相当差距，亚洲各国表示强烈不满。
也许是要弥补《终战决议》的暧昧态度，1995年8月15日，村山富市以内阁总理大臣名义发表谈话，对日本军国主义时期的罪行表示深刻反省和歉意：
“日本在过去不太遥远的一个时期内，国策有错误，走上了战争道路，使国民陷入存亡危机。由于进行殖民统治和侵略，给许多国家特别是亚洲各国人民造成了巨大损害与痛苦。为避免将来重犯这样的错误，我要面对这一无可怀疑的历史事实，再次表示深刻反省和由衷的歉意。”
“今天是战后50周年，我们应该铭记在心的是，回顾过去，从中汲取历史的教训；展望未来，不要走错人类社会通往和平与繁荣的道路。”
“我们必须把战争的悲惨告诉年轻一代，以便不再重犯过去的错误。这对同近邻各国人民携起手来，进一步巩固亚太地区及至世界的和平，同这些国家之间建立基于深刻理解和相互信任的关系，是不可缺少的。”
村山首相的8月15日谈话，是过去日本首相对战争问题最明确的表态，并且是日本首相第—次在正式声明中承认日本的侵略并表示道歉。对此日本评论家们以及国外媒体对村山的谈话给予了积极评价。
同一天，村山对《人民日报》记者所提出的问题，以书面回答方式重申“内阁总理大臣谈话”的精神，强调“要谦虚地正视历史事实，并从中汲取教训，不再重犯过去的错误，这是发展日中两国关系的基础。”
针对记者所提出的“在第50个‘八一五’之际，村山首相想对中国人民说些什么”的问题，村山郑重表示：“痛切反省由于我国的殖民统治和侵略对中国人民造成的巨大损害和痛苦，在此表示衷心的道歉”。
虽然村山内阁对政治的认识比战后日本历届政府都积极，但是，其就任期间，仍有许多高级官僚公开发表违反村山内阁方针的看法。因此，每次这些人发表自己的意见及看法后，均引起亚洲国家的愤怒以及世界各国对村山内阁的怀疑。