在唐太宗面前，魏征就像是一位严师，看到学生有一点过错，就会及时指出来。陈仓的折冲都尉鲁宁因犯法被打入大牢，此人自恃地位较高，不把陈仓尉刘仁轨放在眼里，对刘仁轨是破口大骂，惹得刘仁轨大怒，将其用棍棒打死。地方官员把此事上报给了唐太宗，唐太宗闻听也非常恼火，当即下令将刘仁轨斩杀，命令发出之后，唐太宗的余怒未消，又说道：“这是哪里来的县尉，竟敢杀了我的折冲都尉！”命令把刘仁轨带到长安，他要亲自问个究竟。等把刘仁轨押到长安之后，刘仁轨把鲁宁侮辱自己的过程详细说了一遍，最后说道：“鲁宁当着臣百姓的面把臣如此羞辱，臣确实气愤不过，才杀了他。”刘仁轨言语自若，句句是理，当时，魏征就在唐太宗身边，趁机说道：“陛下知道隋朝是怎么灭亡的吗？”唐太宗问：“你说是什么原因？”魏征回答：“隋朝末年，百姓强横，欺凌官吏，就像鲁宁这样的。”唐太宗顿时怒气全消，把刘仁轨晋升为栎阳丞。刘仁轨是尉氏（今河南省尉氏县）人，自幼好学，隋末大乱，别人都无暇读书，他却总会在空地上写写画画，从未忘了学习，遂博览群书。武德初年，河南道大使任瓌上书，刘仁轨看了他的奏表，改动了几个字，任瓌非常惊奇，遂推荐他为息州参军，后改任陈仓县尉。在他当县尉期间，袁天纲曾对他说：“你终将成为宰相，年寿接近90岁。”后来，刘仁轨果然成为高宗、则的宰相，终年84岁。贞观十四年十月，唐太宗到同州打猎，刘仁轨上书劝谏：“今年秋天大丰收，现在百姓秋收才进行十分之一二，命他们丢下农活，整修道路，供奉打猎，这确实妨碍了秋收，希望陛下稍稍等待十天半月，等秋收完毕再出巡，这样于公于私都有好处。”唐太宗采纳了刘仁轨的建议，不久，又将其晋升为新安县令。
司门员外郎韦元方发给出宫办事的宦官通行证，过于迟延，宦官们就在唐太宗面前告了韦元方一状，唐太宗听后，很不高兴，把韦元方贬为华阴令。魏征劝谏说：“帝王震怒，不可随意发作。前不久为了宦官出宫，竟然深夜下诏，好像与重大军情一般重要，谁不惊骇？况且，像宦官这类人自古以来就难伺候，喜欢搬弄是非，产生祸害，再派这种人独自远行办事，很不妥当，此风不可长，千万要慎重。”唐太宗也接受了。
唐太宗亲自检阅部队，因队伍不整齐，命令大将军张士贵棒打中郎将等各级军官，继而，又觉得张士贵打得太轻，把怒火又发泄到张士贵身上，命令将其交给司法部门审判。魏征劝谏道：“将军们是一个国家的爪牙，让其拿着棍棒打人，这本就不足为后世效法，何况还因其打得轻就把人家打入大牢呢？”唐太宗听了，连忙把张士贵放了。有人劝说唐太宗要亲自批阅各地的奏章，以免受到蒙蔽，唐太宗征求魏征的意见，魏征回答：“此人不识大体，要是让陛下一一亲批，那岂止是中央事务，连州县之事也该陛下您亲自处理了！”
魏征还给唐太宗上书，认为：“掌握大权的朝廷重臣，虽然位高权重，但陛下对他们的信任却不够，因此，这些人也许会心生疑虑，不敢大胆工作，敷衍塞责。陛下在对待大事方面往往失之于宽，可对小罪却过于严厉，随时会发出雷霆之怒，难免因爱憎而不当。把大事交给大臣们处理，把小事交给小臣们解决，这是为政之法。如今，陛下在职务上重视大臣，轻视小臣，可在一些小事上却听信小臣，怀疑大臣。信任那些平素轻视之人，却怀疑那些委任很重的大臣，这样要想治理好国家，能成吗？如果任命一个人担任高级官员，却又苛求他的一些小错，那些个玩弄刀笔的小吏就会见风使舵，舞文弄法，罗织罪名，打击陷害。受到诬陷的大臣如果要自我辩解的话，陛下就会认为他是内心不服；如果不辩解的话，陛下又认为他所犯属实。进退两难，难以自明，所以只好得过且过，不求无功，但求无过，虚伪就会大行其道。”唐太宗接受了魏征的提醒。
一百六十五、再度夭折
贞观十三、四年的大事主要是前面说过的灭亡高昌。
除此之外，还有：贞观十三年二月，唐太宗下诏停止实行世袭刺史制度；四月结社率政变；到了七月，唐太宗册立李思摩为突厥可汗，把东突厥降众北迁到漠南；十一月，吐谷浑王诺曷钵来朝，与弘化公主完婚；这些前面，我们都说过。
到了贞观十四年，当侯君集的大军扑向高昌时，二月十日，唐太宗驾临国子监视察，命国子祭酒孔颖达讲解《孝经》，对国子监内的优秀学生予以赏赐。唐太宗即位后，十分重视儒学，征集天下著名的儒学大师来国子监任教，他本人也多次来到国子监视察，与师生一起讨论经典论著；当时规定，《礼记》和《春秋左氏传》为大经；《诗经》、《仪礼》、《周礼》为中经；《易经》、《尚书》、《春秋公羊传》、《春秋谷梁传》为小经，只要能够弄明白大经的绝大部分内容的学生，都有资格被授予官职。唐太宗还下令增修了一千二百间国子监教室，学员名额增加到了三千二百六十名；像屯营、飞骑等禁卫军里也派去了教师给官兵们讲解经书，能弄懂经文的官兵也可以参加州县的贡举，于是，全国各地的学者都纷至沓来，京师长安学风甚盛，连高句丽、百济、新罗、高昌、吐蕃的酋长们也派遣子弟前来学习，听讲的学生多达八千余人。唐太宗因各派对儒家经典的解释各不相同，又命令孔颖达等人对《五经》进行权威的注疏，称之为《五经正义》，令学生以此解释为标准。