八月一日，突厥军队强行通过了石岭，进攻并州（今山西省太原市）。二日，西线突厥军队则进攻灵州（今宁夏自治区灵武县）。六日，东线突厥军队接连攻击潞州（今山西省长治市）、沁州（今山西省沁源县）、韩州（今山西省襄垣县）。李渊下令安州大都督李靖从潞州道出击；行军总管任瓌驻扎在太行，抵御突厥这次南下。颉利可汗率领十余万大军大肆劫掠朔州地区。十一日，并州道行军总管张瑾与突厥在太谷交战，唐军全军覆没，张瑾脱身投奔李靖。行军长史温彦博被敌人抓获，突厥人因温彦博负责机要工作，询问他国家的军队、粮食等军事机密，温彦博拒不回答，突厥人将其押解到阴山。十九日，突厥军队再次进攻灵武；二十三日，灵州都督、任城王李道宗将敌人击破。二十五日，突厥军队进攻绥州（今陕西省子长县东）；二十六日，颉利可汗在进行了一个月的劫掠之后，向唐朝请和，而后又撤离而去。
九月二日，突厥没贺咄设攻陷了并州的一个县；五日，代州都督蔺謩将其击败。十五日，右领军将军王君廓在幽州击破突厥军队，斩杀了两千余人。同月，突厥人进攻蔺州（今山西省吕梁市离石区）。
十月十七日，突厥人进攻鄯州（今青海省乐都县），唐朝命令柴绍率军增援。十一月八日，突厥人又进攻彭州（今甘肃省西峰市）。
从武德七年开始，当唐朝平定了各个割据势力之后，突厥人就成了唐朝的主要威胁了。武德八年就这样在突厥不断的入侵和唐军的抵抗中度过了，到了武德九年（公元626年）这一形态依然持续着。
武德九年二月二十八日，突厥人进攻原州，唐朝命令折威将军杨毛率军迎击；三月，吐谷浑、党项骚扰岷州，梁师都也攻下了静难镇。二十三日，突厥军队进攻灵州。二十五日，唐朝派遣南海公欧阳胤出使突厥，欧阳胤来到突厥之后，打算率领五十名随从刺杀颉利可汗，没有成功，被突厥人扣押起来。二十九日，突厥军队进攻凉州，凉州都长乐王李幼良将敌人击退。
四月九日，突厥人又进攻朔州；十二日，进攻原州；十五日，进攻泾州（今甘肃省泾川县）。二十日，李靖在灵州的硖石（今宁夏自治区青铜峡市西南）与突厥军队激战，双方从清晨一直战至下午四时，才把突厥人击退。二十五日，突厥军队又进攻西会州（今甘肃省靖远县）。
五月，党项人进攻廓州（今青海省贵德县）；突厥进攻秦州（今甘肃省天水市）；吐谷浑、党项进攻河州（今甘肃省临夏县）；突厥进攻兰州（今甘肃省兰州市）、陇州（今陕西省陇县）。李渊命令平道军柴绍率军抵御。
太史令傅奕上书李渊请求废除佛法，他说：“佛在西域，言语妖妄，路途遥远，汉人翻译的佛经，随心所欲，进行假托。致使那些不忠不孝之人削发为僧，享受与君主、长辈作揖的特权，令那些游手好闲之徒换身衣服，就可以躲避劳役、税赋。谎称六道轮回，恐吓那些愚蠢之人，欺骗那些平庸之徒，于是，这些人就开始忏悔昔日做过的坏事，为的是祈求将来的福报，布施一万钱，就想得到一万倍的回报，斋戒一天，就想换来一百天的口粮。愚蠢痴迷之人妄想追求功德，不怕朝廷禁令，轻易违法乱纪，有的犯下大罪，身陷囹圄，才在监狱里拜佛，希望能被赦免。况且，生死寿夭，全在自然；刑德威福，全由君主；富贵贫贱，在于功劳，可是，愚蠢的僧人却说这都来自佛，这其实是在与君主争权，与自然多利，是最大的乱政！我国从上古以至于秦汉，并无佛法，君主清明，臣子忠诚，国祚长久。汉明帝开始才引进少数民族的神灵，西域的和尚传来了佛法，西晋时期，国家还有严格的法律明令禁止中国人不得削发为僧。自从五胡乱华开始，君主平庸，臣子奸佞，政治黑暗，国祚短促，佞佛的梁武帝和北齐高澄的下场就是前车之鉴。如今，天下的和尚尼姑人数高达十万，浪费绸缎，装饰由泥巴塑的泥人，竞相展示妖术，迷惑百姓。我请求将这十万和尚尼姑进行婚配，国家即可得到十万户的百姓，让他们生男育女，经过十年休养生息，十二年的教育训练，即可向国家提供充足的兵源。这样一来，天下就避免了被这些游手好闲之徒蚕食的灾祸，百姓们也懂得了威福在君主的道理，被迷惑的风气自然会得以改观，淳朴向善之风也就逐渐形成了。我曾经看到北齐章仇子佗的奏疏，称：‘和尚尼姑白白浪费国家资财，佛塔寺院奢侈浪费，耗费国家金银布帛。’和尚们竞相鼓动宰相，尼姑们巴结公主嫔妃，对章仇子佗百般打击、陷害，最后，他竟然被处死了。等到周武帝宇文邕灭掉北齐时，下令封了他的坟墓，以示表彰。臣虽然无能，但我愿意以此人为榜样。”
李渊召集群臣讨论，只有太仆卿张道源赞同傅奕的主张。萧瑀说：“佛是圣人，可傅奕却加以指责，指责圣人的，就是目无法律，要予以治罪。”傅奕反驳道：“作为人，最大的伦理没有超过君主、父亲的，佛身为嫡子却背叛了自己的父亲，又身为一介平民却胆敢对抗天子。萧瑀尊奉无君无父的教育，对尊敬父母这一行为进行非议的人，眼里就没有父母，就是说萧瑀这种人的！”萧瑀无言以对，只是双手合十，说：“地狱就是让这些人下的！”（“非圣者无法，非孝者无亲”是《孝经》上的话，萧瑀以上一句指责傅奕，傅奕就用下一句反驳萧瑀）
李渊对僧人、道士也不满意，觉得他们不遵守戒律，还躲避赋税，正如傅奕所言，加之寺庙建在都市之内，和尚、平民相互混杂，全无静修的样子。于是，李渊下令，全国对和尚、尼姑、道士、道姑进行淘汰，对于那些确实笃信、精修的，迁至大的寺院、道观之内，统一管理，赏赐衣服、食物，至于那些不合格的，则一律勒令还俗；长安城内只保留三座寺庙、两座道观，各州只保留一所，下余的全部废弃。