失去马邑，令颉利可汗勃然大怒。虽然在武德六年上半年，不论是高开道还是梁师都，抑或是苑君璋，都带着突厥军队南下，但突厥人尚未直接撕毁与李唐在去年八月定下的合约，但高满政的降唐以及马邑的失守，突厥人从大漠南北要想深入并州腹地，就失去了一个进攻的策源地，因此，颉利可汗决心对李唐发起新一轮的大规模攻势。
七月九日，突厥在西线开始向原州发起进攻；十一日，在并州方向，大举进攻朔州。李高迁心生恐惧，率领本部人马两千多人擅自撤离马邑，趁夜南逃，但当他们刚刚离开马邑，就遭到了突厥骑兵的截杀，伤亡过半。颉利可汗亲自率众向马邑城发起了猛烈的进攻，高满政率军迎战，有时一天之内激战十余会合。李渊命令驻守崞城的刘世让以及行军总管尉迟敬德前去增援，但刘世让行至松子岭，见突厥军队力量很强，遂不敢继续前进，又退守崞城。李高迁身为太原功臣却不战而退，令李渊大怒，下令将其除名徙边。七月二十五日，李渊下令李建成率军防御关中北部，以李世民率军驻扎在并州，抵御突厥。
八月一日，突厥进攻真州（今陕西省榆林市东北），又进攻马邑；十六日，突厥军队进攻原州；二十八日，突厥军队攻克了原州的善和镇（今甘肃省镇原县西南）；三十日，又进攻渭州（今甘肃省平凉市西）。此后，突厥在西线的攻势减弱，到了九月三日，李建成就受命班师了。
颉利可汗原本是盛怒而来，但当他亲自率军来到马邑城下时，却发现苑君璋已经失去人心，马邑军民同仇敌忾，与突厥人殊死搏斗，这一情况令颉利可汗大感意外。就在两军在马邑前线激战时，双方之间的谈判也在紧锣密鼓地进行着。颉利可汗派人向唐朝求婚，李渊提出条件：“等你解除了马邑之围以后，再提此事。”颉利可汗打算满足李渊的要求，但义成公主却苦苦请求继续发起进攻。因高开道擅长攻城，颉利可汗遂从幽州方向召来了高开道，命其率众猛攻马邑，但仍然未能攻下。颉利可汗派人劝说高满政投降，高满政破口大骂，拒不投降。马邑城内粮食即将吃尽，而唐军救兵迟迟不来，高满政打算率众突围，部下杜士远担心敌人兵强马壮，肯定无法脱身，遂于十月二十日，杀死了高满政，投降了突厥，马邑陷落。入城后，苑君璋又杀害城内豪强以及高满政的同谋三十多人。李渊以高满政的儿子高玄积为上柱国，继承荣国公爵位。
实际上，在九月初，似乎李唐已经与颉利可汗达成了默契，西线突厥军队似乎已经北撤了，太子李建成也得以返回，但由于义成公主的坚持，马邑之战还未结束，因此，李世民还继续留在并州，但却迟迟不曾北上增援马邑，这大约是为了避免继续刺激颉利可汗，不仅如此，就在马邑陷落的前三天，即十月十七日，李渊还下令让李世民班师回朝了！而突厥人占领马邑之后，却在五天之后，即二十五日又把马邑交还给了唐朝，撤军了。李渊以秦武通为朔州总管，实际控制了马邑。
究其原因，大约是因为：当时李唐朝廷已经与颉利可汗达成了协议，但突厥军队还没有撤离马邑城，就在这时，城内的高满政意外被部下所杀，突厥人意外地占领了马邑，占领后，即将城池交还给了唐朝。颉利可汗为何不占领马邑？也许是因为，在颉利可汗看来，突厥人不习惯生活于此地，不可能在这里留下大量的突厥部众，而原本依附于突厥人的汉族军民此时已心向唐朝，与其要一个时常与自己捣乱的边镇，倒不如得到金银财帛、美女更加实惠。颉利可汗满足了李渊的要求，李渊同样也是如此，据《资治通鉴》记载，“突厥恶弘农公刘世让为己患，遣其臣曹般陁来，言世让与可汗通谋，欲为乱，上信之。冬，十月，丙午（初四日），杀世让，籍其家”。刘世让是一位有勇有谋的良将，但正是他的存在，令颉利可汗坐卧不安，必欲杀之而后快，果然，李渊听命于颉利可汗，以莫须有的罪名将其杀死。史书称，李渊杀死刘世让是听信了突厥使者的话，好像是受了蒙蔽，但以李渊的老谋深算，这种说法根本是站不住脚的，李渊岂能轻信对手的谗言？在不久之前，刘世让还给李渊建议扼守崞县，被李渊称赞为猛将，此时怎会轻易诛杀？即便是刘世让增援马邑不力，但也比不战而逃并全军覆没的李高迁要强很多，大敌当前，怎能不经审理匆匆杀掉呢？显然，杀掉刘世让一定是突厥人向李渊提出的条件，史书讳言李唐政府屈从突厥、诛杀良将，才这么说的。事情的真相极有可能是：李唐政府以刘世让的死换取了马邑。
看似危险的北方局势，再一次转危为安。
等到突厥人退去之后，并州大总管长史窦静（窦抗之子）上书请求在太原屯田，以节省运粮之苦，执政者都认为这样一来有可能引发新一轮的骚动，没有答应。窦静反复上表，李渊遂下诏命其入朝，当着自己的面与尚书左仆射裴寂、尚书右仆射萧瑀以及中书令封德彝辩论，裴寂等人理屈词穷，于是，李渊就听从了窦静的建议，后来，每年能增收数千斛谷子，遂任命窦静为检校并州大总管。十一月，秦王李世民也请求增加并州的屯田，李渊同意了。
一百一十六、江南复反（1）
俗话说，福无双至，祸不单行。
当北方狼烟四起之时，李唐周边地区也是一片乱离。一月，嶲州（今四川省西昌市）人王摩沙起兵发动叛乱，自称元帅，改元进通；李渊派遣骠骑将军卫彦前去讨伐。三月，在遥远的江西地区，在去年二月降唐的张善安却再度发动叛乱，李唐朝廷派遣舒州总管张镇周前去讨伐。四月，吐谷浑入侵芳州（今甘肃省迭部县），刺史房当树逃奔松州（今四川省松潘县）。同月，南州刺史庞孝恭、南越州百姓宁道明、高州头领冯暄一起叛乱，攻陷了南越州，并乘胜进攻姜州（今广东省合浦县西北），合州（今广东省雷州市）刺史宁纯率军前去讨伐。五月，吐谷浑以及党项进攻河州（今甘肃省临夏县），李渊命令岐州（今陕西省凤翔县南）刺史柴绍率军救援。柴绍的妻子平阳公主刚刚于本年二月去世，但由于军情紧急，柴绍不得不率军西上。六月，瓜州（今甘肃省安西县）总管贺若怀广巡视境内，来到沙州（今甘肃省敦煌市），当地百姓张护、李通造反，贺若怀广与数百人守卫内城，凉州总管杨恭仁派军救援，反被张护等人击败。接着，张护、李通杀掉了贺若怀广，拥立窦伏明为主，进逼瓜州，被长史赵孝伦击退。同月，柴绍率领唐军与吐谷浑军队作战，被敌人包围，敌人登高射箭，箭如雨下。柴绍命人弹起琵琶，让两位舞女相对翩翩起舞。吐谷浑人感到非常奇怪，个个放下弓箭，驻足观赏，柴绍见敌人放松了警惕，偷偷派遣精锐骑兵绕到敌人背后，突然发起进攻，将敌人打得大败。七月，岗州刺史冯士翙占据新会（今广东省江门市新会区）造反，广州总管刘感前去讨伐，冯士翙投降，刘感让你官复原职。