段达又以皇泰主之命下令打开了皇宫大门，让王世充入宫。王世充入宫后，就把皇宫卫士全部撤换下来，代之以自己的军队，而后，才进入乾阳殿拜见皇泰主。皇泰主对王世充说：“你们擅自相互诛杀，一点也不令我知晓，这岂是为臣之道？你一味动用蛮力，难道还想杀我吗？”王世充跪在地上，泪流满面，连连谢罪道：“臣蒙先帝选拔，即使粉身碎骨也难以报答先帝的厚恩。元文都等人包藏祸心，阴谋招来李渊，危害社稷，痛恨我不肯与他们合作，一直对臣心存猜忌。臣因情势紧迫，为了救命，才没有来得及向陛下禀报。如果我胆敢心怀不轨，辜负陛下，苍天大地与太阳月亮作证，让我全家灭门，断子绝孙！”说完，声泪俱下。皇泰主竟然被王世充的言辞所打动，觉得他还是非常忠诚的，下令把他引上殿来，交谈了很长时间，接着，又带王世充一起进入内殿，拜见太后。在太后面前，王世充更是使出浑身解数，他披头散发，指天发誓，称自己决不敢怀有二心，皇泰主遂任命其为尚书左仆射、总督内外诸军事。等到当天中午，又抓获了赵长文、郭文懿二人，又把二人处死了，而后，王世充又在全城巡视，告诉百官和东都军民诛杀元文都、卢楚的缘由。王世充从含嘉城移居尚书省，逐渐拉帮结派，独断专行，又以他的哥哥王世恽为内史令，入居皇宫，王氏子弟全部掌握军权，把政务分为十类，也全由他的党羽们把持。王世充权倾内外，皇泰主成了名符其实的傀儡皇帝了。

李密行至温（今河南省温县），听说了元文都等人被王世充所杀的消息，就不敢再回洛阳了，而回到了金墉城。徐文远是南北朝时期南齐宰相徐孝嗣的玄孙，李密过去曾拜他为师，徐文远担任皇泰主的国子祭酒，当时，东都城内物价飞涨，粮食匮乏，徐文远亲自出城砍柴，结果被李密的士兵抓获了。李密见到徐文远后，对他非常尊重，让他面南而坐，以弟子之礼参拜。徐文远说道：“老夫既然受到将军如此敬重，岂敢不进尽忠言？只是我不知将军究竟是打算做出伊伊、霍光那样兴亡继绝之事呢？还是另有所图？如果是这样的话，老夫自然愿意替将军效力；如果将军像做出王莽、董卓曾经干出的忤逆之事，您就用不上我了！”李密回答：“我刚刚接到朝廷的命令，任命我为上公，我自然愿意尽心竭力，匡扶社稷，这也是李密我的本意。”徐文远又说：“将军是名臣之子，误入歧途，以至于到了今天这个地步，假如你能迷途知返，亦不失为忠义之臣啊！”等到王世充火并了元文都等人后，李密又征询徐文远的意见，徐文远回答：“王世充也是我的学生，此人性格残忍偏执，心胸狭窄，既然已经走了这一步，肯定会心生异志，将军原来的打算就泡汤了。如果打不败王世充，就不能再入朝了。”李密说道：“过去我觉得先生只是位儒生，不识时务，今日做出的决策竟然如此英明啊！”因此，当关中的李世民奉命率军西上、准备发起第二次浅水原之战时，东都附近的李密和王世充却处于一种不战不和的暧昧状态中。

李密自从诛杀翟让、大权独揽之后，逐渐产生了骄傲自满情绪，对部下很不关心；瓦岗军控制的粮食虽多，但却没有钱财、布帛，因而将士们立下战功，李密却拿不出什么东西来犒赏，另外，李密对于新近归附的隋朝官吏们非常优待，凡此种种，都令瓦岗军的基干力量非常不满。徐世勣就曾经在宴会上当面讽刺李密的缺点，惹得李密很不高兴，把徐世勣派往黎阳，表面上看是让他当了一方大员，但实际上是李密嫌弃他。

李密大开洛口仓放粮，既没有负责负责的官员，也没有布置警卫，也不需要文书，谁想来搬运粮食，能搬多少，都行。有人把粮食搬出仓库后，又无力搬回家，就随意扔到路边，以至于从仓城到外城城门之间的道路上竟然堆积了数寸厚的大米，车马随意践踏；来自全国各地前来谋生的流民高达百万之众，人们没有瓦罐木盆，就把荆条编织成箩筐淘米，大量稻米遗弃在水中，以至于洛水两岸十里之内，远远望去瓦如一片白色沙滩。李密见状，反而高兴地对贾闰甫说道：“这真可谓是粮食充裕了！”贾闰甫回答道：“国家以民为本，民以食为天。如今，百姓之所以扶老携幼纷纷前来，是因为天在这里啊！然而，有关部门却对粮食毫无吝惜，如此糟蹋浪费，我只恐一旦粮食吃光、百姓四散，大人将与何人共成大业呢！”李密向贾闰甫表示歉意，遂任命其为判司仓参军事。

身为瓦岗军主帅的李密与东都隋军主帅的王世充对局势有着截然不同的判断：在李密看来，瓦岗军曾多次击败过东都隋军，如今，城内的隋朝文武之间又发生了火并，东都城内的粮食又极端匮乏，在他看来，拿下东都是迟早的事，因此，产生了盲目乐观情绪；与李密相比，王世充对局势有着更为清醒的认识，他深知东都隋军与瓦岗军之间实力悬殊，要想一举击败瓦岗军，就必须剑走偏锋，出其不意，攻其不备，所以，在王世充大权独揽后，就重重犒赏将士，争取人心，修缮武器，积极备战，但在表面上却维持着一团和气。当时，东都城内粮食匮乏，而李密军中缺少布帛，王世充派人请求互通有无，李密开始时并不情愿，但李密的长史邴元真等人想趁机谋取私利，遂劝李密答应了王世充的请求。在此之前，东都城内的隋军将士每天都有上百人出城投降，等到城内得到粮食以后，投降的人就越来越少了，李密这才后悔了，终止了交易。

李密终止交易以后，东都隋军立即又重新面临被困死的老问题。瓦岗军自从大破宇文化及之后，元气大伤，精兵猛将死伤很多，剩下的将士伤病、疲惫，部队战斗力大大减弱，王世充侦查到这一情况后，就决定奋起一搏，拼死一战。他担心人心不齐，旧爱谎称左军卫士张永通三次梦见了周公，在梦中，周公命其转告王世充，让王世充率军出战，届时，周公将出动天兵天将相助，于是，王世充在城内给周公修建了一座庙宇，每次出战，事先总要入庙祈祷一番。王世充又命巫师向将士们宣称周公指示仆射要速速讨伐李密，会立下大功，不然的话，将士们将会暴病而死。王世充军中的士兵们大多是南方人，笃信鬼神，听了巫师的话，都纷纷请战，于是，王世充挑选了两万多精兵，两千多匹战马，九月十日，王世充率领这支隋军从洛阳城出动，前去讨伐李密，旌旗之上都写着永通字样，军容严整，声势浩大。