全琫准只是翻了翻白眼，压根没理会他，一出手又攻下了灵光城。
洪启薰没有别的招数，只好一边向政府请救兵，一边硬着头皮带兵去剿。没成想他一动身，起义军就跑了。
洪启薰大喜，也不等朝廷派来的援军，直赶义军而去，从灵光赶到兴德，又从兴德跑到咸平，然后从感平折向长城群。官兵跟着跑得上气不接下气，洪启薰叫苦不迭，向上头打报告道：“东逐则西去，西逐则东去，万无剿灭之道……伏乞借外兵以助之，使彼道尾不接，音信不通……”
5月24日，义军突然不跑了。他们转身而坐，在长城郡城南的南月坪洞布了一个口袋，将官军引进袋内，四面围殴。官军一下子被打死打伤200多人，其余人哭爹喊娘、溃不成军。洪启薰毕竟是当过武艺厅别监、护过闵妃逃跑的大内高手级人物，身手敏捷，连滚带爬地逃出了包围圈，败走灵光县，闭门不出。
全琫准也不理洪启薰，带兵直奔全州。5月31日，金文铉、林泰斗等人弃城奔走忠清道，李氏朝鲜龙兴之地全州便于次日陷开义军之手。
当初洪启薰向朝鲜政府打报告请求“借外兵以助之”时，其政府高层对借兵于外国尚心存，怕别国借此机会插手朝鲜内政。然当起义军迫向全州城时，朝鲜政府再也管不了那么多了，闵泳骏急匆匆地找到了袁世凯：袁大人，看在属国的份上，拉兄弟一把吧！
日本代理公使杉村浚探知朝鲜向清国求兵的消息，即向袁世凯来打探消息，表达了对目前局势关切之意，“倘久不平，殊可虑”，并隐隐表示日本不干涉之意。袁世凯与杉村浚本来熟稔，自以为拿到了日方的底牌，也便大胆地向国内发起了求兵电报。
6月3日，朝鲜内务府参议成岐运向清国提交照会，请求出兵。
清国朝廷当下即下达命令，“派令直隶提督叶，选带劲旅，星驰往朝鲜全罗、忠清一带，相机堵剿，克日扑灭。一俟事竣，仍即撤回，不再留防。”
正好是这会儿，日驻天津领事荒川已次很“凑巧”地拜访了李鸿章。说了一大通跟杉村浚差不多的话。早就接到了袁世凯报告的李鸿章不疑有他，便很憨厚地回答道：咱们已经应朝鲜的要求出兵了，不过你们也勿需担心，照会是有的，咱们事竣即撤回，决不久留。
6月4日，李鸿章下令，调直隶提督叶志超、总兵聂士成、夏青云为将，带领2500人，在扬威、平远等5条军舰的掩护下，前往朝鲜。
6月6日，驻日公使汪凤藻按原约向日方向出照会，并向国内发回电报：日驻朝鲜公使大鸟圭介“带捕二十名立赴韩，并添调一舰护商。”李鸿章发回指示：现在汉城没啥事，请与其协商，让他撤回人马。
6月7日，日本外务省回复汪风藻：大日本帝国从来没承认朝鲜是清国属邦，望予更正。
同日，日本以《天津条约》为由，命驻清代理公使小村寿太郎照会清国方面：“朝鲜内乱炽烈”，日方将向朝鲜派兵“一队”。事实上，就在6月2日的内阁会议上，伊藤博文已经决定出兵朝鲜了，只不过等待清国给他们这个借口而已。
亦是同7日，朝鲜，察觉形势不对的袁世凯一日数电，向李鸿章汇报。李鸿章对急剧而下的局势，脑袋似乎有些转不过变来：前几天不是你袁世凯说出兵没事的吗？怎么才几天功夫，马上转弯了？他并不知道，就在6月5日，清兵出动的消息刚刚传到日本，明治政府立即成立了战时大本营，已经铁下心要开打了。
在清廷由毫无戒心转而狐疑，迟迟不决间，两国大军先后向朝鲜开进。6月8日，清国第一批部队，聂士成所统的芦防军910人自牙山登陆；第二批部队是叶志超的榆防军1055人和粮秣辎重，于12日上岸完毕；夏青云所率的第三批部队500人由于其后清、日为撤兵问题争论不休，举旗不定，直到该月下旬才派往朝鲜。
日方一方自6月5日起陆续将军舰调到仁川港。至6月10日，港内已有日军舰松岛、千代田、八重山、筑紫、赤城、大和等六条，实力远胜于北洋舰队在朝鲜部署的海军力量。同时，大鸟圭介在400名水手、丨警丨察编成的陆战队的护送下，进入汉城日公馆。
就在此时，出兵的理由消失了。
得知日方变脸的消息，朝鲜政府除了向日方提出抗议外，派严世永加紧与起义军接洽谈判事宜。不知是中、日出兵威慑了起义军的指挥官们，还是全琫准担心继续与政府对抗会给予外国干涉的借口，6月11日，原来一直不肯和解的起义军与朝鲜政府达成了史称《全州和议》的12条停火协议，起义军撤出全州城，政府也默认起义军在部分地区的自治状态。
就在这个时候，对川上操六的话心领神会的玄洋社人组成了“天佑侠”团，兴趣勃勃地“火上添油”来了。这个天佑侠团原本是在釜山居住的吉仓汪圣、武田范之、大崎正吉等9人组成的一个原本计划支援东学党起义的团体，却一直没闹出什么动静，直到铃木天眼（二六新报主笔，大概是嫌拿笔杀人不过瘾，直接挽袖子干才玩吧）、玄洋社的内田良平、大原义刚等人从国内赶来后，一行14人于6月底从釜山出发，前往全罗北道的淳昌与全琫准会面。
全琫准并没有按照自己提出的“严惩私通倭人者”、“ 逐灭夷倭”砍掉这几位战争狂人的脑袋，但他们的工作也确实算不上有什么成果——因为，日本军方基本没有理会朝鲜政府与东学党义军达成和解的消息，继续向朝鲜派兵。6月12日，作为侵朝先头部队的大岛（义昌）混成旅团的第十一联队第一大队及其配属部队登陆仁川，并于次日进入汉城，接手原来陆战队的防务。其余部队并相继而发，至16日时，在朝日本步、骑、炮及其它辅助兵种人员总数已逾4000人。此时，日军占汉城，清军驻牙山，乌云压城城欲摧，大战有一触即发之势。