作为文禄之役中堪与日军对敌的兵种，朝鲜的水师主力舰种为板屋船（李舜臣自吹的龟船这玩艺儿数量似乎不多，在战争到底发挥多大作用还难说，从对它的描述来说其实应该算是板屋船的加强版），装备有口径不同的火炮（铳筒）及各种包括手铳、弓弩在内的远射武器，可配备战斗人员百余人。

此外还有中型的战船狭船与小型的辅助船只鲍作船。整个舰队火力较为凶猛，多采取远程打击战术。

日方与朝鲜方面相对敌的各等级船只有安宅船、关船和小早船。自第一次木津川海战失败后，织田信长在令九鬼隆嘉新造的船上配备了大铁炮等火器，提高了战船的远程打击能力。但日军水师的战术大体上还是以近距投掷纵火物、跳帮越船，以击杀敌人占据敌船的接舷战为主，从火力和战术上总体落后于朝鲜方面。

五月七日，李舜臣的突然在巨济岛的玉浦港出现，猛轰停靠在港湾里的五十余只日船。弹落之处，或水花飞溅，或木屑四迸，船穿水涌。霰弹扫来，如雨骤至，把甲板上的日军扫倒一大半；火箭带啸声从天而降，朴朴地钉在甲板上、船帆上，燃起熊熊大火。身上着了火的士卒翻滚着，嘶叫着，从船上跳下大海。幸存的日军以大小铁炮、箭矢还击，却因射程不及远，弹丸不是掉到海里，也就只给朝舰留下几个白点点而已。

过不一会，日军只得留下二十多条正在慢慢地沉入海中的船只，四散而逃。

得胜回师的朝鲜水师在返航途中，又碰到了五条傻呼呼大摇大摆地闯了进来的日本船。一阵炮击，击沉了其中四条。另外一条如梦初醒，夺路而逃。

次日，在赤珍浦水域，李舜臣等人如法炮制，截击了一支由十三艘船组成的日本舰队并击沉其中十一艘，而朝军未失一舰。已经安全登陆的日本诸将不禁头皮发麻：若我那时候在船上，应该如何时是好？何不准已经跟龙王爷亲密接触去了呢。

其后四多个月时间里，李舜臣等水师将领一直游弋在海面，与暴怒的日军水军作战。在六、七月唐浦等系列作战中，日军连战连败，损失战船数以不计其数，来岛通之等人被击毙。尤其是在七月八日的闲山岛海战、安骨浦海战中，李舜臣、李亿祺、元均联手先是击破胁板安治所部，差没点要了这位贱岳七本枪之一者的老命，又打败了来追的九鬼、加藤水军，击沉日军船只上百艘（李舜臣自述，似有夸大的嫌疑）。

李舜臣等人的战斗给背辱中的朝鲜带来一丝亮色，如果朝鲜的陆军也有水师般的水准的话，即便不能挡得住日军的进攻，至于也能拖慢敌人的进攻步伐，等到大明援军的到达，不至使国家糜烂至此。

然而，朝鲜陆军的表现除了“无能”二字外，也实在找不到别的词形容。龙仁之战，数万大军，被数百日军，一驱而散。小西行长、加藤清正在休整十来天后，两军大踏步前进，以诱敌之计，击破临津江一线之敌，迅速拿下陪都开城。加藤清正杀向咸镜道，小西行长则进入黄海道，迫向平壤。

与无能的军官相比，朝鲜民众的反抗却是可圈可点。人称红衣将军的郭再佑以儒生的身份起家，在四月底就捐出家财，聚合族人与村民，组织义军，不停地袭扰日军，宜宁等地成了日军的禁忌之地，连光头大名安国寺惠琼都败在他的手下。

由于日军的过度杀戮，更多被激怒的朝鲜人舍生忘命地投入反日队伍，姚敬金、金千镒等一大批杰出将领涌现，给日军予以沉重的打击。为此，有朝鲜官员说：灭倭救国，实乃义兵之力也。

义兵的贡献自不可抹杀，然单靠义兵之力“灭倭救国”的说法纯属没办法在无能的官兵身上找亮点，而转从老百姓身上找回面子、自圆其说而已。事实上，在汉城陷落之后，老得已经不怎么清醒的丰臣秀吉已经把朝鲜当成了囊中之物，提出了打败大明后的二十五占领方针：后阳城天皇移至北京，以北京周围的十国（大抵他想所中国切得象日本一样零零碎碎？）为皇族领地；明国的关白由丰臣秀次担任；日本的关白由羽柴秀保或宇喜多秀家出任；朝鲜归羽柴秀胜或喜多秀家等等。至于他自己嘛，则安排到宁波，那地儿正是控制中国、朝鲜、日本、东南亚的好地方——看来，他的胃口还不止于大明，越南、印度等国在他的那一盘很大的棋里，还真是一个不能少呢。

六月初，小西行长先头部队抵达平壤一线，要求与朝鲜议和。小西行长的代表柳川调信、景辙玄苏仍是那一套调调：假道伐明，望能让开道路等等。

要说李氏朝鲜方面别的不行，在拥明抗倭这点底线守得还是比较彻底的。朝方代李德馨表指出：日本如果真是与大明“恢复关系”，应该从浙江、福建进行；所谓假道伐明，分明是要亡我朝鲜。何况大明乃朝鲜父母之国，宁愿玉碎，岂能让路？

和谈就这样破裂了