李世民眼看尉迟敬德、长孙无忌等人个个意志坚决，若不从众人之言，他的天策府将立即分崩离析，终于改口道：“那好罢，去把房玄龄、杜如晦二人召回来，我等发动政变，需要一个合法的名义，让他俩负责起草檄文。”李世民手下之前早已探得房玄龄、杜如晦离开长安后的隐居之地，火速去请二人。那两人听说太子和秦王要在宫内火并，不是你死就是我亡，吓得哪里敢来，遂都婉言拒绝了李世民的召唤。李世民听后，将自己的佩刀交给尉迟敬德，吩咐他道：“你再跑一趟，他们两个若还不来，你直接把他俩的人头割了带回来。”尉迟敬德持刀外出，不久便把房玄龄、杜如晦两个活人都请回来了，由于这些人在秦王府进进出出，都乔装打扮，像房玄龄、杜如晦甚至伪装成道士前来，李建成、李元吉对此毫不知情。经秦王府文武官员集体密谋，最终将伏击李建成、李元吉的地点定在了玄武门，也就是宫城的北门。因此这次政变，史称：玄武门之变。
武德九年，公元626年六月初三，李建成、李元吉尽除李世民心腹的计划即将付诸实施，齐王李元吉的出征日期已被纳入倒计时。就在这一日，突然有官员秘密向唐高祖汇报：“秦王正准备谋反！”
此事非同小可，唐高祖不敢大意，因为他知道：他同意李元吉带着李世民的那些心腹（基本都是唐朝的开国功勋）外出送死这件事儿实在做得很不地道，他心里也一直担心自己的二儿子会不会选择铤而走险。经他询问，那位举报李世民谋反的官员答道：“根据昨夜的星象看，有一颗金星掉在了秦王的封地境内，这不正说明秦王即将拥有天下吗？”
唐高祖如释重负：“星象之说，不足为信，当然了，借着此事敲打敲打秦王也是好的。”他派出特使赶赴秦王府，质问李世民是否真有谋反的想法。李世民大喊冤枉，急忙随使者前往朝堂，上奏唐高祖道：“难道是大哥和四弟当初收取了王世充和窦建德的贿赂，所以暗中使人诬告臣儿，想替王世充和窦建德报仇吗？”唐高祖仔细打量李世民，见他神情激愤，不似作伪。想到他之前为大唐出生入死，开拓江山的那些功劳，唐高祖语气缓和下来，反而安慰李世民道：“你和你大哥、四弟明日一早都来朝堂，当面辩论此事，朕会亲自审判。好孩子，如果你确实对皇位没有非分之想，为父一定替你主持公道。”
“多谢父皇。”李世民施礼退下。他走之后，唐高祖另派人前往太子府和齐王府，让李建成、李元吉和李世民一样，明早都到朝堂来。
第二日一大早，天才蒙蒙亮，李世民就带着长孙无忌、尉迟敬德、房玄龄、杜如晦、秦琼、程咬金等九人悄悄埋伏在玄武门内侧。李建成、李元吉不知有伏兵在等待他们，随后也朝玄武门过来。快到宫城北门时，有人密报李建成：“玄武门一带情况似乎有些异常，很可能有人要加害太子。”李建成与李元吉讨论这事，李元吉道：“这一定是二哥顾惜手下，决定发动政变，请大哥与我立即回府，托称有病，不能上朝，以便观察形势。”李建成想了一会儿，说道：“我料李世民不敢拿你我怎样，再说宫中戒备森严，他胆子再大，也绝不敢在宫城之内堂而皇之的杀人。你我还是尽快去觐见父皇吧，免得有人说我俩心中有鬼，所以才抗旨不尊。”于是二人继续朝着玄武门前进。
过了玄武门，前方不远即是临湖殿，李建成、李元吉听见身后有马蹄声响起，回头一看，李世民带着一行人正快速向他俩逼近。李建成吓得魂飞魄散，大喊：“快跑！”李元吉取出弓箭，对准李世民连续发射了三次，都被李世民从容躲开。李世民勒住战马，拉满弓弦，只回射了一箭，便将李建成射落马下。他随后瞄准李元吉，正准备发射第二箭，大队禁军听说玄武门附近发生打斗，纷纷过来查看状况。李世民的战马见一下子来了许多人，受到惊吓，突然冲往附近的一片树林，途中战马的缰绳被树枝刮到，那匹马重心不稳，马失前蹄，顺带着把李世民也狠狠摔在地上。李世民挣扎着爬起身来，还没来得及查看伤口，他的脖子已被一根弓弦缠住了，李元吉方才见李世民当他的面射死大哥，骑着马紧随着李世民也一路追到树林里。他睁着猩红的双眼，使出浑身的力气，要在此地勒死李世民。李世民身上有伤，无力反抗，眼看形势危急，尉迟敬德带着第二波伏兵—埋伏在玄武门外侧的七十多名骑兵相继赶到，他高声呵斥李元吉道：“你看见我来了，还不快逃？”李元吉非常惧怕尉迟敬德，见他前来搭救李世民，慌忙抛下手中的长弓，徒步向树林外逃去。还没逃多远，一支箭从尉迟敬德的手中射出，将李元吉也射死了。
李世民长出了一口气，未及与尉迟敬德答话，远方有人大声喊道：“快关闭玄武门，长林兵来了！”原来，太子府的两千三百护卫常年枕戈旦待，一听说玄武门发生兵变，迅速赶来支援。秦王府这边，第三波军队也恰巧赶到，人数大约三四百人。当下，太子府的护卫和秦王府的护卫发生了激烈的交战，甚至有人擂响战鼓，吹响号角，仿佛数万大军在沙场决战。尉迟敬德将李元吉的头颅一刀斩下，又找到李建成的尸首，将其头颅也一刀斩下，他一手提了一个人头，来到长林兵面前，给他们过目。长林兵见李建成、李元吉皆已被杀，因过度惊慌而迅速溃散。
是啊，太子和齐王都已命丧黄泉了，打败了李世民又能怎样？唉，只怪我们来得太晚，散了散了。
玄武门血流成河的同一时间，唐高祖正在宫内一处名叫海池的湖泊里悠哉悠哉地划船，他一边划着船，一边等他三个儿子过来开辩论会。结果他手都划酸了，几个儿子一个都没到，唐高祖察觉到异常，这才急忙上岸，赶去朝堂，询问发生了什么状况。这时，尉迟敬德身披铠甲，手持长槊闯入大殿，当着皇帝的面跪下，一言不发。身后有其他禁军将领紧随着他赶来，神色慌张地向唐高祖汇报：“今早太子和秦王各带大队兵马展开械斗，属下们不知该相助于哪一方，只好看着他们厮杀，现在秦王似乎已经获胜了。”唐高祖听了这话，非常震惊，问尉迟敬德道：“你说，到底发生何事？”
尉迟敬德道：“太子和齐王今早起兵作乱，秦王当机立断，亲自镇压了他们。现在两位贼首已经伏诛，各部禁军将领因陛下恰好不在朝堂，暂时皆听从秦王调遣。秦王担心陛下受惊，特任命末将为警卫，率先赶来大殿，以维持朝堂的秩序。”
唐高祖这才醒悟，三个儿子的辩论会开不成了，李建成、李元吉都已经死了。他强忍悲痛，问朝堂上的那些心腹官员，如裴寂、萧瑀、陈叔达等人道：“事已至此，诸位爱卿，你等认为朕该怎么做呢？”
唐高祖的内心全是悲痛，而裴寂等人的心中则全是恐惧—尉迟敬德能够毫发无伤地带着武器进入大殿，这说明什么？这说明玄武门政变之后，皇宫之中原本效忠于皇帝的禁军部队，已经全部改向李世民臣服。他们窃窃私语了数句，以萧瑀、陈叔达二人作为代表，进谏唐高祖道：“大唐的江山本来就是秦王打下来的，李建成、李元吉不但没有功劳，还时常诋毁秦王，像这种邪恶之徒，人人得而诛之，秦王诛杀了他们，是大快人心啊。依下臣们之见，呃…陛下不如干脆正式册立秦王为太子，将国家政务全都交托给他，这样就天下太平，不会再发生事端了。”
唐高祖听完该提议，颤颤巍巍地站起身来，含泪大笑道：“二位爱卿言之有理，传位给秦王正是朕平生的夙愿！”当时，太子府、齐王府的护卫主力虽然基本溃散，但宫城内外，仍有零星的打斗。尉迟敬德随后又向唐高祖提议：“陛下既决定将国事全部交由秦王处置，可立即下诏，命令所有的宫廷禁军、前太子府护卫、齐王府护卫等人皆受秦王一人节制。违抗秦王命令者，即是不尊朝廷，不尊陛下，是大唐的叛逆。”唐高祖准奏，于是宫城内外彻底安定下来，所有的军队将领不论之前受谁统领，几乎全都前往李世民帐下报到。
玄武门之变结束了，经过这场著名的政变，李世民从此成为了唐朝的最高统治者。事后，李世民跪在高祖皇帝面前痛哭，唐高祖对他一句指责都没有，反而抚慰他，希望他能理解自己之前不能立他为太子的苦衷。
三个爱子火并，一下子死了两个，这对唐高祖来说，可谓是人世间最大的痛苦。可是他作为一位杰出的政治家，也清楚地认识到，这时候再争论是非过错已经没有任何意义了—朕如今只剩下李世民这一个嫡子，不传位给他，还能传位给谁？就算朕再愤怒，难道还能把他也杀了不成？
就这样吧，过去的事让它过去，朕也算是解脱了，终于不用再在两个儿子之间举棋不定。希望李世民能够好好珍惜他用政变的方式夺来的大权，更希望他不会蹈杨广的覆辙，成为虎头蛇尾的昏君，能够一直做一个好皇帝。
玄武门之变结束两个月后，唐高祖正式宣布退位，从此为太上皇；八月初九，李世民多次推辞无果，正式接受父皇的禅让，即皇帝位，并于第二年起改元贞观。李世民即中国历史上最杰出的帝王之一唐太宗，他统治下的唐朝，即将进入该朝代的第一个强盛时期，史称“贞观之治”。
玄武门之变，我用比较简练的方式进行了概述，不过这次政变最根本的原因我还是特意进行了强调。那就是李世民在杀死亲兄弟和看着那帮战友们去送死之间作了选择。
无意替他美言，但李世民确实有不得已之处。