史万岁这一通猛打猛追，于整场战役来说只是一个插曲。但就是这个插曲，无意间竟激化了一场隋朝内部的政治斗争。到这一年，隋朝建国已达二十年，隋文帝克勤克俭，任用贤才，统一中原，攘夷北方，是中国历史上最杰出的帝王之一。但是这位帝王有一桩心事，他已年过六旬，日后该由谁来继承他留下的遗产—强大、富庶、统一的大隋王朝。
长达近三个世纪的南北分裂，起源于晋武帝司马炎选择了错误的太子—“白痴皇帝”司马衷；结束于周武帝宇文邕选择了错误的太子—“疯子皇帝”宇文赟。这两位错误太子造成的严重后果，让缔造了“开皇之治”的隋文帝不敢掉以轻心。之前，他的长子，当了二十年太子的杨勇无疑是皇位的第一继承人；但近来他的第二个儿子晋王杨广南征北战，立了太多的功劳，逐渐更受他的器重。
正当隋文帝在为选杨勇还是选杨广，到底该册封谁为最终的储君举棋不定时，杨素和史万岁回来了。这两位隋军大将，私底下实则早已分成了不同的派系，简单说，杨素支持晋王杨广，史万岁支持太子杨勇。隋文帝一看，好家伙，史万岁指挥部下斩杀了这么多敌人，缴获了这么多战利品，立下了大功啊；杨素咋回事，你和杨广带去的兵马比史万岁还多一些，就这么空着手回来，啥功劳也没有？
杨素不但是杀人如麻的常胜将军，也是位老谋深算的权术高手。他一直处心积虑在找机会帮助杨广夺取太子之位，这回一看，机会来了！于是他不慌不忙地把长孙晟的分析复述了一遍，当然，他没说这是长孙晟的观点，而是晋王杨广高瞻远瞩，刻意保存西突厥的实力，从而维持两部突厥的分裂—若不然，我军完全可以趁着西突厥人因中毒陷入混乱的契机，对其展开猛烈打击，等史万岁来了，战场都打扫完了，哪还轮得到他立功。隋文帝一想，是这么个理，顿时转怒为喜，果然还是晋王考虑得周到；这史万岁只顾着自己砍人头，完全不顾全大局，这不是给国家添乱么。他遂下诏奖励杨素，至于史万岁则不予任何褒奖。
史万岁傻眼了，我率军奔袭数百里，追击敌人至王庭，缴获了这么多战利品回来，没有功劳也有苦劳吧，怎么陛下权当视而不见？他当然不服，聚集了数百部下，准备入朝伸冤。杨素得讯，趁机又向隋文帝大进谗言：“史万岁因怨恨陛下赏赐不公，仗着有太子撑腰，正召集部下，打算图谋不轨。”隋文帝一查，史万岁确实正与数百部下在“商议大事”，越想越震怒，竟下令禁军将史万岁押至朝堂，当着百官的面将他杀了。
史万岁死后，隋文帝念及他的勇猛无畏和过去建立的功勋，渐渐表现出悔意—不管怎么说，奋勇杀敌对一名将军来说总是值得赞扬的优点，哪怕史万岁鲁莽了一点，但也绝对罪不至死。可在这时候，又有一人站出来推波助澜，谁呢，独孤皇后。说到这位皇后，笔者个人对她有个评价：做对了九十九件事，只做错了一件事。综观独孤皇后一生，可谓处处是闪光点，杨坚称帝之前，面对周武帝的严加防范，同属鲜卑族的独孤伽罗毅然站在了丈夫这一边，用独孤氏在关中的强大威望和影响力保护着她那羽翼未丰的丈夫；杨坚成为隋文帝后，同样也晋升为皇后的独孤伽罗并未沾沾自喜，她几乎是呕心沥血，相助她的丈夫将隋国一步步打造成大隋王朝。隋文帝崇尚节俭，独孤皇后身体力行，最先作出表率；隋文帝身为汉人，建国之后将隋朝的制度全面恢复为汉制，独孤皇后身为鲜卑人后裔，积极响应这一改革；隋文帝缺少一位好的宰相，独孤皇后立即向他举荐了高熲—后来隋朝确立三省六部制，平定南陈，完善法律，营造粮仓…等等，许多重要工作都是在高熲的主持下得以顺利完成。
独孤皇后的优点很多，缺点只有一个：善妒。杨坚当了皇帝后，心想之前的那些皇帝都有三宫六院，再不济，连周武帝都有五六个嫔妃，朕的后宫里只有独孤皇后一人，是时候找机会扩充一下后宫了。刚好有大臣向他推荐，说尉迟迥有一孙女模样标致，品行端庄，封她为嫔妃，可以表明陛下对尉迟迥后人的宽容态度，化解汉族、鲜卑族两大民族之前结下的仇恨，隋文帝于是封该女子为嫔妃。然而才过了几日，独孤皇后就趁着隋文帝上朝的机会把尉迟迥的孙女活活打死了。隋文帝对此勃然大怒，但又不忍心责罚他的结发妻子，只能维持着一夫一妻制长达九年；隋朝建立九年后，隋军攻灭陈国，把陈后主一族老少尽数俘虏到长安，又有大臣向隋文帝提议，说陈后主有一位妹妹姿色出众，性格聪慧，若封她为嫔妃，可以笼络来降的陈国旧臣人心，防止陈后主因畏惧责罚而召集旧部作乱。独孤皇后在大臣们的劝说下，这一次收起了大棒，没再竭力阻止，隋文帝这才得以册封陈后主之妹为宣华夫人。
其实这事也不能完全怪独孤皇后，因为杨坚当初并不知道自己日后会做皇帝，曾向独孤伽罗发过誓言：终身只娶你一人。独孤皇后的错，并非她严格要求发过誓言的丈夫—谁让他杨坚发过誓呢，发誓了就得遵守。而是她以同样的要求，来约束她那些未发过誓的儿子们。她和隋文帝一共生育了五个儿子，其中四个儿子都同时宠幸多名女子，唯有晋王杨广单独宠幸一人，他的原配妻子萧氏。独孤皇后为了这一点，格外的喜爱晋王杨广，没事就嚷嚷着让隋文帝换太子，把杨勇废了，让杨广入主东宫。隋文帝前期还算比较理智，后来见晋王杨广的功劳越来越大，又实在顶不住皇后的枕边风，就让她负责考察杨勇的为人，名为考察，实为监视。独孤皇后在监视杨勇的过程中，和同样支持杨广的大将杨素很快达成了政治同盟—杨素说杨勇对皇帝不满，经常口出怨言，独孤皇后立即向隋文帝禀报，说杨勇对您十分的不满，日夜的诅咒父皇；杨素说杨勇可能有不轨之心，之前史万岁回朝时，曾私下去东宫与太子相见，独孤皇后立即向隋文帝禀报，说杨勇已经决定谋反，连图谋作乱的武器都打造好了。太子杨勇察觉此事，曾苦苦哀求自己的亲生母亲，希望和父皇见一面陈述冤情，却反而被独孤皇后从此软禁在东宫。杨勇迫于无奈，只好爬到东宫的一颗大树上，大声地呼唤父皇，希望隋文帝能够听见。隋文帝确实听见了，让皇后和杨素去看看太子到底在喊什么，皇后、杨素去了一趟，回来后皆道：“陛下，您的长子已经心神丧失，沦为了一个疯子，世间无药可医了。”
经独孤皇后和杨素联手迫害，公元600年十一月，出征塞外归来的杨广正式取代他的兄长杨勇成为了隋朝太子，也就是未来的隋炀帝。