89、平定内乱（1）
孙瑒的归降，让陈朝轻松控制了长江中游战略要地郢城，也为陈军收复湘州创造了条件。
因此，著名史学家吕思勉先生给予孙瑒以高度的评价，他说：孙瑒此举“不忠于一姓，而忠于民族、国家，且举可以自擅之地而奉诸朝廷，可谓君子矣！”
江陵陷落后，巴、湘之地（今湖南省）全部落入北周之手，北周让后梁派兵驻守。陈朝得到郢城以后，即命令武州刺史吴明彻率军向武陵挺进，北周对此不能坐视不顾，遂派遣司马贺若敦率领一万人马向武陵发起突袭，吴明彻无力抵挡，率军撤回到了巴陵（今湖南省岳阳市），接着，到九月七日，北周江陵独孤盛率领水军将要南下巴湘，与贺若敦水陆并进，于是，陈文帝命令太尉侯瑱从浔阳率军抵御，九月十三日，陈文帝派遣仪同三司徐度率军与侯瑱在巴丘（今湖南省岳阳市南）会师。
当时，秋水泛滥，周军断粮，独孤盛和贺若敦只好分散军队，四处抢粮，以供应军需。贺若敦担心侯瑱发觉周军粮少，在军营里堆积了很多土堆，将大米摊在土堆上面，招来当地百姓，假装询问别的事情，然后再把他们放回。侯瑱听到百姓们的报告，遂信以为真。贺若敦等人又增修堡垒、住宅，表示要长期待在这里，当地百姓无法从事农业生产，而侯瑱等人也对周军无可奈何。
开始时，当地百姓经常驾着小船，给侯瑱军队送去大米、鸡鸭。贺若敦对此很是忧虑，就命令士兵们假扮成当地百姓，也在船上满载物品，却在船舱内埋伏了武士。侯瑱军人望见，以为是百姓们的运粮船又来了，争先恐后地跑来迎接，不料，周军突然从船舱内杀出，将陈军全部活捉。周军中经常有人骑着马投降陈军，贺若敦就取来一匹马，让人牵着它上船，却命令船上的人拿着皮鞭迎面就打，反复多次以后，这匹马再也不敢上船了。然后，贺若敦就在长江岸边埋下伏兵，让一个人骑着那匹惧怕船只的马向江中的陈军呼喊，谎称要向陈军投降。侯瑱派兵迎接，纷纷牵马上船，可是，那匹马就是不肯上船，就在这时，周军伏兵突然杀出，将下船的陈军全部杀死。从此以后，即使再有真正送粮食的以及投降的，侯瑱也认为有诈，一律不予接受了。
十一月十五日，侯瑱在杨叶洲（湘江注入洞庭湖处小岛）击败独孤盛，独孤盛弃舟登岸，构筑堡垒自守。十九日，陈文帝下诏命令侯安都率众与侯瑱会师，一起讨伐周军。
十二月二十二日，北周巴陵（今湖南省岳阳市）城主尉迟宪投降，陈朝派巴州刺史侯安鼎驻守在那里。二十三日，独孤盛率领北周残兵败将偷偷从杨叶洲撤离。
天嘉二年（北齐孝昭帝皇建二年、武成帝太宁元年，公元561年）年初，北齐孝昭帝命令王琳前往合肥，在当地募兵，再做打算。陈朝合州刺史裴景徽是王琳哥哥王珉的女婿，请求率领他的私人武装充当向导。北齐孝昭帝看到建康空虚，遂命令王琳与行台左丞卢潜率军南下，但王琳一直是犹豫不决。裴景徽担心事久变生，匆忙逃奔北齐，偷袭建康的计划遂告破产。北齐孝昭帝任命王琳为骠骑大将军、开府仪同三司、扬州刺史，镇守寿阳（今安徽省寿县）。
一月二十四日，北周湘州（今湖南省长沙市）城主殷亮投降，湘州又回到陈朝的手中。二月，陈文帝任命侯瑱为湘州刺史。
侯瑱与贺若敦相持时间长了，侯瑱无法取胜，最后，侯瑱提出，只要贺若敦等人愿意放弃江南的土地，返回江北，愿意借给周军船只让他们渡江。贺若敦担心是个圈套，没有答应。侯瑱又派人对贺若敦说：“大人在此已经很久了，如今我愿意借给你船只，送你回国，你为何不离去呢？”贺若敦回答：“湘州是我国的土地，受到你们的侵略。我来的时候目的是要把你们赶出这里，双方还没有决出雌雄，所以我不离去。”侯瑱又派人前来，贺若敦说：“如果真心实意想让我撤离，那么，你们要离我百里之外。”侯瑱把船只留在长江岸边，然后率军离去。贺若敦派人侦查，得知没有圈套，这才登上船只，回到了长江北岸，周军将士病死的有十分之五六。武陵郡（今湖南省常德市）、天门郡（今湖南省石门县）、南平郡（今湖南省安乡县北，侨郡）、义阳郡（今湖南省安乡县，侨郡）、河东郡（今湖南省松滋县，侨郡）、宜都郡（侨郡，今地不详）全部被陈朝收复。北周晋公宇文护因贺若敦丧师失地，将他削职为民。《周书》将贺若敦撤离的时间记为七月，而上述一番贺若敦北渡长江之前与侯瑱的对话，也出自《周书》，《资治通鉴》也照单全录。由于侯瑱是三月份就去世的，而《周书》却记载贺若敦是七月才北渡长江的，因此，有学者怀疑《周书》的记载是虚假的，甚至于上述对话，也是凭空捏造的，不过是为了掩饰贺若敦战败而已。
三月，侯瑱病死，陈文帝又以徐度为湘州刺史，四月，将荆州又分出一个南荆州，治所设在河东郡（今湖南省松滋县），以吴明彻为南荆州刺史。
截至陈文帝天嘉二年（公元561年）年初，也就是在陈朝建立四年之后，疆域才勉强与南梁末年相似，与北周、北齐划江而治，不久，陈文帝就把处理国内的半割据政权摆上了议事日程了。
当初，陈武帝把女儿丰安公主嫁给缙州（今浙江省金华市）刺史留异的儿子留贞臣为妻，征召留异为南徐州刺史，但留异一直迟迟不肯离开老巢，前去上任。陈文帝即位后，又任命留异为缙州刺史，并兼任东阳太守。留异多次派遣长史王澌入朝，王澌回去后总是说朝廷力量薄弱，留异信以为真，虽然表面上服从朝廷，但其实首鼠两端，王琳东下时，留异曾派信使翻越鄱阳（今江西省鄱阳县）信安岭相互联络。王琳兵败后，陈文帝派遣左卫将军沈恪接替留异，实际上是想偷袭他。留异率军驻扎在下淮（在今浙江省桐庐县与富阳县之间），沈恪率军迎战，却战败了，退回到钱塘（今浙江省杭州市）。不久，留异又上书道歉。当时，陈文帝集中精力要收复郢州和湘州，于是，就坡下驴，发出诏书予以劝慰，暂时笼络住他。留异也知道朝廷终究不会放过他的，遂发兵驻守在下淮、建德（今浙江省富阳县），切断水路。
如今，陈朝已经收复了湘州、郢州，天嘉二年（公元561年）十二月十五日，陈文帝任命司空、南徐州刺史侯安都率领大军讨伐留异。此时，北齐的武成帝高湛刚刚即位一个月零四天。
在侯安都讨伐留异的同时，陈文帝也征召江州刺史周迪镇守湓城，又征召他的儿子入朝。熊昙朗败亡后，部众大都被周迪收编，周迪拖延观望，既不去湓城上任，也不让儿子入京。陈文帝又向南川各地更小的割据势力发出诏命，令他们入京，但他们大多都与周迪保持一致，拒不接受诏书，陈文帝正用兵留异，无暇一一征讨，只是暂时笼络住他们。豫章太守周敷本为周迪的下属，此时，他率领部众最先入朝，陈文帝大喜，进周敷军号为安西将军，给鼓吹一部，并赏赐给**、金银、财帛，让他又回到了豫章。
陈文帝不仅没有把周敷留下，相反给予其大量的赏赐，还让他安然无恙地回到了豫章，这一高明的策略是为了让那些拒不从命、但又忐忑不安的割据势力放心，也为了瓦解周迪阵营。果然，周迪听说后，心里非常不高兴，就暗中与留异联络，派遣他的弟弟周方兴率军奔袭周敷，周敷出战，大破周方兴。周迪又派遣侄儿在船中埋伏武士，假扮商人打算偷袭湓城，还没有行动，就走漏了消息，浔阳太守监江州事华皎派兵截击，将这支偷袭部队全部俘获。
在笼络南川各地豪强的同时，陈文帝也没有忘记闽州（今福建省福州市）刺史陈宝应。他任命陈宝应的父亲陈羽为光禄大夫，子女们也都加官进爵，并把陈宝应一家编入宗室户籍，但是，陈宝应却娶了留异的女儿为妻，暗中与支持留异。太子中庶子虞荔的弟弟虞寄流落到闽中（福建省），虞荔思念弟弟，以致于得了病，陈文帝特意征召虞寄回京，但陈宝应却扣留虞寄不放。虞寄曾平静地向陈宝应解释顺逆的道理，陈宝应总把话题岔开。陈宝应曾躺在床上让人给自己读《汉书》，听到蒯通劝说韩信时说：“我看大王的脊背，贵不可言。”陈宝应一下子坐了起来，说道：“真是一位智者！”虞寄说：“蒯通一句话令三位贤士被杀，怎么能称他是智者！怎比得上班彪的《王命》懂得天命！”虞寄知道陈宝应听不进任何劝谏，害怕大祸临头，遂身着隐士衣服，谎称得了脚病，隐居在东山寺内。陈宝应让人烧掉虞寄的房子，虞寄躺在床上一动不动，家眷要把他扶出，可是虞寄却说：“我的性命在刀口之下，能到哪里躲避？”纵火的人只好又把虞寄救了出来。