此战陈军生擒刘伯球、慕容子会，斩杀俘获敌人一万余，缴获了南梁、北齐的全部辎重、武器。王琳乘坐快艇突围而去，行至湓城，打算集结残兵败将再战，可是却无人响应，无奈，只好带着妻妾、亲随十余人逃奔北齐。南梁侍中袁泌、御史中丞刘仲威保护着永嘉王萧庄，战败后，袁泌用小船把萧庄送到北齐境内，刘仲威带着萧庄回到了齐国，袁泌拜辞而回，投降了陈朝。王琳部将樊猛及其哥哥樊毅率众投降。
二月十六日，陈文帝下诏：“官宦之家，将帅士兵们身陷王琳乱党的，全部赦免，随才任用。”二月二十三日，陈文帝任命太尉侯瑱为都督湘州、巴州等五州诸军事，镇守湓城。
陈武帝死后，北周才将陈昌、陈顼送回，但因王琳横亘在郢城，陈昌二人只好滞留在安陆（今湖北省安陆市）。等到王琳失败后，陈昌才从安陆出发，继续南下，将要渡江时，他给堂兄陈文帝陈蒨写信，言辞傲慢。陈蒨刚刚即位数月，地位还很不稳固，陈昌的到来，对陈蒨来说决不是什么好事，毕竟陈昌是陈霸先的亲儿子，陈蒨只是陈霸先的侄儿，陈昌不在，陈蒨称帝还勉强说得过去，陈昌来了，陈蒨再赖在皇位上，就显得名不正言不顺了。想到这里，陈蒨心里很不是滋味，他把侯安都叫来，装作心平气和地说道：“太子马上就回来了，这下我得找一个藩国，作为养老之地了。”侯安都回答：“从古以来，哪里有被替代下去的天子！臣愚蠢，不敢奉命！”遂请求陈蒨派自己前去迎接陈昌。
可能是在侯安都鼓动下，当时的陈朝群臣也都明白了陈文帝的心思，于是，大家纷纷上书请求加封陈昌一个爵位，二月二十八日，陈文帝下诏任命陈昌为骠骑将军、湘州牧，封衡阳王——这等于是向陈昌表明，你来到江南，也只能当臣子，我是不可能给你让位的。
三月二十三日，陈昌进入陈朝国境，陈文帝下诏命令主书、舍人沿途迎接，二十五日，陈昌乘船渡江，行至江心，侯安都下令将其杀害，把尸体投入长江，负责迎接的官员回复称陈昌失足落水而死。
陈文帝对侯安都非常感激，他很快就把侯安都晋升为清远公；侯安都的父亲原任始兴内史，陈文帝将要把他的母亲迎接到建康，侯安都的母亲不愿离开故乡，陈文帝特意在始兴设置了东衡州，以侯安都的堂弟侯晓为东衡州刺史；侯安都的儿子侯密年仅九岁，陈文帝任命他为始兴内史，让他在家乡侍奉奶奶。
虽然陈文帝对侯安都非常感激，但侯安都却恃宠而骄。经常聚集文武群臣骑马射箭、饮酒赋诗，文士有褚玠、马枢、阴铿、张正见、徐伯阳、刘删、祖孙登，武士则萧摩诃、裴子烈等，座上宾客动辄上千人。陈军将帅大多不遵法度，因犯法受到政府追究后，大多都逃到侯安都军中，虽然陈文帝也无可奈何，但暗暗怀恨在心，侯安都却毫无觉察。侯安都上书言事，奏表已经封口，他突然又想起某事，也不重新撰写，就随意打开封口，在原文上亲笔写下：“另外报告某事云云”，显得很不恭敬。陪陈文帝喝酒时，酒酣耳热之际，侯安都甚至两腿叉开，斜靠在茶几之上。有一次，侯安都陪陈文帝在乐游园饮酒，他一再追问陈文帝：“现在与你当临川王时相比怎么样？”陈文帝没有回答，可侯安都却不识趣，一个劲地问个不停。陈文帝只好说道：“这虽然是天命，但也全靠你啊！”喝完酒，侯安都又请求陈文帝把宴会上的帷帐借他一用，侯安都不过是想在他的妻妾们面前显摆一下。陈文帝虽然答应了，但内心很不高兴。第二天，侯安都坐在陈文帝曾经坐过的位置上，宾客们都坐在群臣的位置上，向侯安都敬酒祝寿。恰巧重云殿发生了火灾，侯安都率领军队进入宫殿，陈文帝已忍无可忍，暗中做好了戒备。
与陈昌一起回到建康的还有陈顼的侍从毛喜，回到建康后，毛喜向陈文帝建议要结好北周，陈文帝答应了，遂派遣侍中周弘正出使北周。
芜湖大战时，陈文帝曾征召江西的半割据势力参战，江州刺史周迪、高州刺史黄法氍接受命令，率领水军将要出发。熊昙朗却占据要塞，挡住了他们的去路，周迪等人遂与周敷一起将熊昙朗包围起来。王琳战败后，熊昙朗的军心大乱，周迪趁势攻克了他的城池，俘虏熊昙朗的部众一万多人。熊昙朗逃入村中，被村民所杀，三月六日，熊昙朗的人头被送到建康，陈文帝下令诛灭了熊昙朗的全家。
在芜湖大战之前，北周军队已经包围了郢城，郢州助防张世贵献出外城投降了周军，外城三千多军民也一同没入周军。北周军队在内城城外构筑土山、修造长梯，不分昼夜进攻内城，趁着风势烧毁了内城城南五十余座碉堡。南梁郢州刺史孙瑒率领不足一千战士，殊死苦战，他亲自安抚守城将士，一一劝酒送饭，将士们个个誓死与郢城共存亡。北周军队无法攻克郢城内城，遂授予孙瑒柱国、郢州刺史，封万户郡公，拉拢孙瑒；孙瑒假装接受，却趁机整修守城装备，很快整修好装备后，又率众登上城墙固守。不久，北周军队听说了王琳在芜湖战败、陈军即将到来的消息，遂撤离郢城北返。孙瑒召集部下们说：“我与王大人一起辅佐王室，竭尽心力，可如今却到了这步田地，这难道不是天意吗！”于是，他向陈文帝派出使者，献出长江中游之地请求归降。北齐军队原来驻守在鲁山（今湖北省武汉市汉阳区东北），孙瑒投降陈朝后，三月七日，北齐军队只好放弃城池撤离，陈文帝下诏命令南豫州刺史程灵洗率军驻守在那里。三月十三日，陈朝设置武州（今湖南省常德市）、沅州（今湖南省沅陵县），以吴明彻为武州刺史，孙瑒为湘州刺史。孙瑒内心不安，恳请交出兵权，入朝为官，陈文帝遂将其征召为中领军，但不久，又改任其为吴郡太守。