四月，尔朱天光率部来到汧水、渭河之间，逗留休息，停止前进，对外宣称说：“现在天气转热，不是进军的良机，要等到秋凉以后，再商议进军事宜。”万俟丑奴派来的侦查兵，凡是被魏军捉住的，尔朱天光均温和地对待他们，然后予以放还。这些人回到安定以后，给万俟丑奴带去的话也是魏军要等到秋后才发起进攻，万俟丑奴遂信以为真，分散部队到细川（今甘肃省灵台县）进行农业生产，另外，他还命令太尉侯伏侯元进率领五千兵马在岐州以北一百里的泾川，依托险隘，修筑营栅，边耕作边防守。另外，在他的周围又有几处一千人的营栅。

尔朱天光侦查到万俟丑奴的兵力已十分分散，在一天傍晚，遂秘密下令整顿军队，暗中派遣轻装骑兵先行切断各个交通要道，以防走漏了风声，而后，各路魏军一齐出发。经过一夜的急行军，黎明时分，魏军突然包围了侯伏侯元进的大营，并一举将其攻克，攻克侯伏侯元进的大营以后，魏军将俘虏全部释放，附近各个营栅闻讯遂全部投降。

此地距离安定一百八十里，解决了侯伏侯元进之后，尔朱天光又率部昼夜急行军，乘胜北进，很快就进抵安定城下，叛军泾州刺史侯几长贵举城投降。万俟丑奴抛弃平亭大营逃跑，将要逃往高平（今宁夏固原市），尔朱天光派遣贺拔岳率领轻装骑兵追赶，四月二十二日，贺拔岳在平凉（今甘肃省平凉市）长平坑追上了万俟丑奴。

叛军尚未列好阵势，直阁将军侯莫陈崇单骑冲入敌阵，于马上生擒叛军主将万俟丑奴，遂大声呼喊，叛军无人敢挡。很快的，魏军骑兵相继杀入，敌众各自逃散，遂大败。侯莫陈崇十分骁勇，擅长骑射，谨慎寡言，贺拔岳将万俟丑奴所乘的宝马、宝剑、金带赏赐给了他，因生擒万俟丑奴之功，侯莫陈崇被加封为安北将军、太中大夫、都督，封临泾县侯，食邑八百户。

第二天，尔朱天光即率领大军包围了高平，城内百姓逮捕了萧宝寅投降。

四月二十九日，北魏朝廷因关中平定，宣布大赦。万俟丑奴和萧宝寅被送到洛阳，捆绑在宫城正南门阊阖门外大街上，供百姓围观了三天。丹阳王萧赞上表请求饶恕萧宝寅一命，吏部尚书李神俊、黄门侍郎高道穆过去就与萧宝寅有私交，也想替他求情，对孝庄帝说：“萧宝寅叛乱发生在前朝。”正巧应诏王道习从外面回来，孝庄帝问王道习在外面听到了什么消息，王道习回答：“只听人们说李尚书、高黄门在替萧宝寅周旋，二人都处于非常重要的位置，肯定能够保全他。况且，二人说萧宝寅是在前朝发动的叛乱，可是他担任万俟丑奴的太傅，难道不是发生在陛下登基以后吗？叛贼如果受不到惩处，国家的法律又将如何去实施！”于是，孝庄帝遂下令在驼牛署将萧宝寅赐死，在洛阳街市中将万俟丑奴处斩。萧宝寅死前，李神俊携带酒肉前去，二人诉说旧情，李神俊黯然落泪，而萧宝寅却毫无惧色，显得非常平静，只是说：“推天委命，恨不能最终尽到臣节。”萧宝寅之妻宣武帝的姐姐、南阳公主非常贤惠，夫妻二人一直相敬如宾，她带着孩子面对将死的丈夫恸哭流涕，伤心欲绝。南阳公主共给萧宝寅生下三子：萧烈、萧权、萧凯。萧烈娶了孝明帝的妹妹建德公主，萧宝寅谋反后即被北魏朝廷处死；萧权与萧凯比赛射箭，萧权被弟弟射死；萧凯娶了长孙稚的女儿，轻薄无礼，南阳公主多次训斥她，萧凯竟然对母亲怀恨在心，在萧宝寅被杀数年后，萧凯在其妻的挑拨下，派奴仆将南阳公主害死，萧凯也被绞死，其妻被斩首。萧宝寅一家就这样灭绝了。萧宝寅及其一家的命运就是一出惊心动魄的人间悲剧。

万俟丑奴被擒后，从泾州、豳州以西一直到灵州（治所在今宁夏灵武县）的叛军大多都归顺了北魏朝廷，只有万俟丑奴的行台万俟道洛、费连少浑尚盘踞在原州（今宁夏固原市），不知道万俟丑奴已经战败，尔朱天光派人联络城内的李贤，令其里应外合图谋万俟道洛。正巧万俟丑奴的部下万俟阿宝从前线逃回，他对李贤说：“万俟丑奴已经战败，官军行将到此，阿宝我把性命托付给你了，望你能保护我。”李贤遂令万俟阿宝假扮万俟丑奴的使者，欺骗万俟道洛说：“如今大王已经击败官军，需要与大人商议军务，命令阿宝暂时主持原州事务，大人可迅速前去。”万俟道洛信以为真，当天就率部离开原州东去。万俟道洛离开城池后不久，尔朱天光就率领大军到了，遂不战而进入了原州。万俟道洛只好率领六千人马逃入山中，拒不投降。当时高平境内大旱，尔朱天光因当地没有牧草，遂率军撤退至城东五十多里的地带，息兵放牧，并派遣都督长孙邪利率领二百人进入高平州城，代行原州（高平镇改为原州）州务，以李贤为主簿。万俟道洛见魏军远在五十里外，遂偷偷派人入城联络城内居民，偷袭长孙邪利，当时，城内尚有一千多万俟道洛的同党做内应，万俟道洛又将城内的二百魏军全部杀死。尔朱天光得知高平有变，遂率领魏军反扑，万俟道洛出战而败，率部西逃到牵屯山（今宁夏固原市西）中，扼守险要。尔朱荣因尔朱天光没有活捉万俟道洛，又丧失了长孙邪利，又派人打了尔朱天光一百军棍，并以孝庄帝的名义贬尔朱天光为抚军将军、雍州刺史，将其爵位降为侯。

尔朱天光率军进入牵屯山追剿万俟道洛，万俟道洛战败，率领数千骑兵南下进入陇山，投靠略阳（今甘肃省清水县）叛党王庆云。万俟道洛素来骁勇绝伦，王庆云得到他以后，非常高兴，自以为大事可成，遂自立为皇帝，任命万俟道洛为大将军。