冯太后处理的第三类人是拒绝与自己合作的人，这类人以宜都王拓跋目辰为代表。拓跋目辰与李等人同时被调任雍州，但是，不久，他就遭遇了杀身之祸。史书给出的理由是：拓跋目辰在任期间“好财利，在州，政以贿成。有罪伏法”，但他被杀的真实原因大约是他“性亢直耿介，不为朋党，朝臣咸惮之。”不为朋党，就是不为冯太后所用。

在清除了异己势力的同时，冯太后开始大肆培植自己的势力，她首先想到了进一步提高自己娘家的权力和地位。冯太后失散多年的哥哥冯熙，在冯太后成为文成帝皇后以后即被找回，娶了文成帝的姐姐博陵长公主为妻，拜驸马都尉、定州刺史，进爵昌黎王；献文帝即位后，为太傅、内都大官。此时，冯太后又加封其为侍中、太师、中书监、领秘书事。冯熙此人性格豁达，又笃信佛教，与世无争，他担心自己久处高位，有倾覆之患，就坚决予以推辞，冯太后想想，只好同意，改任其为车骑大将军、开府仪同三司、都督、洛州刺史，侍中、太师如故。有妹妹在朝中撑腰，冯熙在洛州期间，为政贪婪，随心所欲，经常将百姓的女子强夺为婢女，姿色上好的，就纳为姬妾，因此，生下了几十个儿女。博陵长公主给冯熙生下了两个儿子，一个冯诞、一个冯修。两人长得都非常秀丽，十几岁就被冯太后召入宫内与孝文帝一起学习，冯诞性格宽厚，冯修却非常浮躁，冯诞娶了孝文帝的妹妹乐安长公主，后被封为驸马都尉、侍中、征西大将军、南平王，冯修被封为侍中、镇北大将军、尚书、东平公。冯诞与孝文帝的关系非常亲密，“同舆而载，同案而食，同席坐卧。”冯诞经常把弟弟的过错向冯太后汇报，招致了冯修的不满，阴谋毒害哥哥，事情败露后，被削职为民。冯太后还让冯氏家族与拓跋皇室、贵族建立了广泛的姻亲关系。在冯太后的安排下，孝文帝前后将冯熙的四个女儿都纳为嫔妃，其中两个为皇后，一个早死、一个为左昭仪。《汉魏南北朝墓志集释》中的《元悦妃冯季华墓志》记载，冯熙共有八个女儿，“长姊为南平王妃；第二、第三姊，并为孝文皇帝后；第四、第五姊，并为孝文皇帝昭仪；第六姊，为安丰王（献文帝六弟拓跋猛之子元延明）妃；第七姊，为任城王（献文帝八叔任城王长子拓跋澄）妃……”

其次构建自己的统治核心。如前所述，在冯太后发动政变之初，她主要的是依靠的是亲信宦官、恩幸们的支持，除了赵黑等宦官们之外，在冯太后第二次临朝称制后，另外一个人的崛起特别引人注目，此人就是王叡。王叡，字洛诚，自称祖上是太原人，西晋末年大乱其六世祖迁往姑臧，他的父亲王桥懂得天文术数，拓跋焘平定凉州后，被迁至平城，死在侍御中散职位上。王叡身材魁伟，相貌堂堂，继承了父业。文成帝的父亲拓跋晃当皇太子的时候，见到王叡就曾啧啧称奇，文成帝继位后被提拔为太卜中散，后晋升为令，兼太史。承明元年，冯太后发动政变前后，可能是为占卜吉凶之事而见到了王叡，这一年，冯太后35岁，王叡43岁，男人四十一朵花，一见之下，冯太后就被眼前的这位成熟的帅哥弄得神魂颠倒，很快两人即效于飞之乐，王叡也随之被破格提拔为给事中，紧接着，又被晋升为散骑常侍、侍中、吏部尚书，赐爵太原公，成为冯太后心腹中的心腹，一刻也离不了。太和二年，冯太后与孝文帝率领百官及各国使节前去观赏老虎，谁知，一头老虎从虎圈中逃出，登上了阁楼，几乎跳到了孝文帝和冯太后的御座旁，冯太后和孝文帝身边的侍从都四散而逃。在这千钧一发之际，王叡独自手持长戟对着老虎，老虎见状才悻悻而去，王叡这次临危不惧、舍身护主的壮举，在冯太后和孝文帝心中留下深刻印象，对王叡更为信任。太和三年，冯太后下诏将王叡与另外一个重臣拓跋丕同时列入八议，享有犯罪以后必须由皇帝亲自裁决或者减免处罚的待遇，同时，其亲属也享受永远免除赋税的待遇，第二年，又晋升其为尚书令，封中山王，加镇东大将军，设置王官二十二人，以中书侍郎郑羲为傅，郎中令以下全部是北魏当时的名士。又拜王叡的妻子丁氏为妃。冯太后还经常赏赐给王叡大量金银财宝，深夜由亲信宦官、卫士秘密用车辆送到王叡府上，这是秘密的赏赐，还有不得不公开赏赐的田园、奴婢、牛马、杂畜等物，为了显示没有私心，冯太后还另外拿出上万钱财一并赏赐给其他大臣。