十二月初九，孙传庭二抵真定，按照圣旨移调巩固营兵，可是分监陈镇夷拒绝移交，圣旨在陈太监这里居然不灵。孙传庭又为刘光祚部讨要行粮，保定巡抚张其平还算不错，两天后如数拨付。十二日，孙传庭带着卢象升派往真定要粮的赞画杨廷麟一同南下。十三日行至藁城，得到了卢象升贾庄兵溃的败报。
得知卢象升兵溃贾庄，孙传庭急忙由藁城东进至晋州，收拢卢部溃兵。晋州在贾庄以北二百里，兵溃当日，卢象升战死，虎大威、杨国柱、李重镇等各自率残兵突围，现听说孙传庭在晋州，陆续前来归队。
十二月十四，孙传庭把卢象升兵溃的情况上报兵部，第二天又向朝廷请月饷，并申请调祖大寿所部归他指挥。十七日，吴襄所部五千辽军到了晋州听用，孙传庭一看五千人马全是步兵，一匹马都没有，原来根本不是他想象中骁腾如虎的关宁铁骑，而且萎靡疲顿都是各营挑剩下的次品，又是闷闷不乐。
外敌入寇，照常理，明廷军民自然协力同心共御清军，令人奇怪的是，地方士民百姓竟然恨兵如仇，一听说朝廷部队来到，立即紧闭城门，将锅碗瓢盆，鸡犬牛羊全部带走，关厢房屋惟存四壁，不留一粒粮食给明军，竟然是用对付侵略者的方式来招呼官军。真定以南，孙传庭所经过的州县，在清军洗劫之后，残破不堪，十室九空，如今又有大军到来，地方实在无力供应。他的部队进入沿途村庄问百姓收买粮食，百无一应，官军虽然领了饷银，换不来粮食，还是不得一饱。粮食早就被清军和跟在清军屁股后面的明军驱剿部队抢光，到了孙传庭这里已经是颗粒皆无，他老孙来晚啦。
孙传庭不由得皱眉，如此光景，不说没有可用精兵，就是身边有个数万，也是解决不了给养问题，部队饿的嗷嗷乱叫，不但不能御敌，而且极有可能哗变倒戈相向。
十二月初六奉命出京督察的内阁首辅刘宇亮，带着一千余京营部队，由副将周遇吉统率作为他的标营，一出永定门，就放慢脚步，缓辔而行，七八日之后才到了保定。刚进城就听得卢象升在贾庄兵败身亡，刘宇亮惊惧交加，急忙写信转告杨嗣昌：“他的任务是督察卢象升，如今督察对象已死，不知道何去何从”。未奉明旨又不敢调头回北京，只得硬着头皮再往前走。两天后，刚踏入真定府东北的安平县，探马来报，前方发现大股清军，刘中堂吓得面无人色，不知如何是好，有幕僚献计，听说新任兵部侍郎孙传庭现在晋州，可去与其合兵，以避清军。刘宇亮和孙传庭是同年，都是万历四十七年的进士，彼此相识，觉得此计大妙，立即向西奔向晋州。
晋州与安平距离一百余里，一两日可到，刘宇亮到了晋州城下，不巧孙传庭刚离开晋州，同年没有见着。
孙传庭在晋州收拢了千余贾庄溃兵，感觉肩上任重事艰，百孔千疮，难以措手。他觉得最突出的问题不在地方，而在中央，杨嗣昌这个兵部尚书应付危局的能力实在不敢恭维。命他办如此大敌，而兵将如此单微，粮饷如此窘迫。兵部只是稳坐京城发号施令，不论调拨的部队是否真正能战，只要拨给一兵，就说有兵；也不论粮饷是否真正接济，只要给地方州县发文，就说有饷，官僚主义、形式主义极其严重。
兵将寥寥，粮饷又困难，不足以南下驱剿，孙传庭想在真定一带驻防，拱卫京师。崇祯不许，命他相机进剿，不得以驻防拱卫为辞，孙传庭只好照办。
十九日，标将李国政从贾庄战场找回卢象升失落的督师关防，带回情报说清军仍在巨鹿以南抢掠，孙传庭离开晋州，往东南方向的冀州而去征剿。
孙传庭前脚刚走，刘宇亮就来晋州找他，老孙没见到，却在晋州城下吃了闭门羹。晋州知州是江西南昌人陈弘绪，十一月他率领全城军民拼死击退来犯的清军，对官军只会跟着清军屁股尾随恨之入骨。清军退走后，满城军民劫后余生，陈弘绪和百姓歃血为誓，绝不放一名援剿官军进城。孙传庭来的时候，因为孙从千里之外的陕西赶来，不是从北京而下的援剿部队，陈弘绪也敬佩孙的威名，就放了进来，就如此晋州百姓也有怨言。
现在又来了个刘宇亮，陈弘绪不再客气，紧闭城门。刘宇亮命人拿他的令箭进城，宣称如不开城要以军法从事，满以为陈弘绪一定开门迎接。陈弘绪回话：“督师之来以御敌也，今敌且至，奈何避之？刍粮不继，责有司，欲入城，不敢闻命。”坚决不给粮草、不让进城。
堂堂内阁首辅、援军督察进不了大明国的一座州城，刘宇亮气得发疯，马上弹劾无法无天的陈弘绪，崇祯看了也很生气，命锦衣卫逮其进京。晋州的老百姓不答应了，一起来到北京给陈知州喊冤，愿意代他领罪的竟有一千余人，崇祯最后只得从轻发落将其降级调用。
腊月二十三，北方的小年，孙传庭到了冀州，得到情报清军东犯临清、德州，战火已经蔓延到山东境内。次日，孙传庭自冀州东进，二十五日过枣强，接到高起潜疏揭，要他到临清守城，替换原守城的高部，高部要出兵剿敌。卢象升死后，高起潜成了驱剿军事的唯一最高指挥官，孙传庭奉命协剿须听命于他，只得南下入鲁，于次日午后进抵临清，高起潜已在城内相候，还有河道总督周鼎、另一名分守太监齐九皋。孙传庭将他的全部步兵：吴襄辽军五千、刘光祚兵一千、他的秦兵五百发上城头防守。
临清和德州是鲁北门户，都是大运河北段的重要码头，财物丰饶，存有朝廷大量税银。兵部将此二城作为重点防卫对象，命高起潜守临清；山东巡抚颜继祖守德州。
二十八日，孙传庭接到圣旨，命他以兵部左侍郎兼督察院右佥都御史总督各镇援兵，仍赐尚方剑。差官捧着敕谕一道，尚方剑一口，只是督师关防、符验、令旗令牌还未一同送来。孙传庭在临清公署恭设香案叩头谢恩，这下他从协剿成了督剿，不用再听高起潜的指挥。