茹成名被神一魁出卖，他原来的弟兄议论纷纷，都说神一魁受抚后蜕化变质，不顾往日情义，沦为朝廷鹰犬。
另外两个大头目黄友才、张孟金在九月十八突然劫持神一魁，拉起原来的人马反叛，攻占了宁塞营，远近震动。
这一下，杨鹤的形象彻底倒塌，遭到舆论一边倒的狂轰滥炸。连曾替杨鹤辩白过的巡按吴甡也痛打落水狗，参劾杨鹤主抚误国。
崇祯怒了！九月二十三，严旨痛斥杨鹤“杨鹤总制全陕，何等事权！乃听流寇披猖，不行扑灭，涂炭生灵，大负委任。着革了职，锦衣卫差的当官旗扭解来京究问！”
十月十一，杨鹤在耀州接到讯息，命他到临潼接旨。杨鹤急忙赶到临潼，跪下听宣。
听完之后，杨鹤呆若木鸡，趴在地上顿觉天旋地转。浑浑噩噩被锦衣卫押到北京，离开他任职两年六个月的三秦大地，再也没能够回来。
杨鹤被解拿进京，一路之上，前思后想，万分委屈。他想不明白，七月皇帝还表扬他相机招抚，允协朕意，怎么两个月后就突然翻脸痛斥他乃听流寇披猖，不行扑灭，涂炭生灵，大负委任，好像流寇猖獗全是他杨鹤一人之过。
想到此处，杨鹤觉得可能是皇上一时误信谗言，于是问锦衣卫差官要来纸笔，写了一份题为“咫尺天颜束身待罪”的陈情奏疏，向皇帝陈述他的不白之冤。
杨鹤还是不了解崇祯的性格，他这里说冤屈，那不就是埋怨崇祯处理得他不对？杨鹤太高估了崇祯的气量，如果他俯首帖耳低头认罪，把全部的责任都揽到自己头上，崇祯可能还会对他从宽发落。现在他公然鸣冤叫屈，崇祯看了更加恼怒，训斥杨鹤赶紧闭上嘴巴，老老实实接受审讯，不得陈辩。
杨鹤被逮后，崇祯把陕西巡抚练国事也降了三级戴罪自赎，提升延绥巡抚洪承畴为三边总督，倒是和杨鹤的保举一样。
洪承畴（1593-1665），字彦演，号亨九，福建泉州府南安人。万历四十四年（1616年）进士，时年24岁。
洪承畴幼时家境贫寒，可是天资聪颖，刻苦读书。万历四十三年（1615年），23岁的洪承畴中了举人，第二年又中了殿试二甲第十四名进士，正是“京报连登黄甲，”年少登科，一步跨入龙门。
此后，洪承畴在刑部任职六年，一直做到正四品的郎中，基本上每年都有升迁，一帆风顺。
天启二年（1622年），洪承畴外放到浙江，做了提学佥事，两年后升迁两浙承宣布政左参议。由京官外放到地方任职通常是丰富官员的履历，往往是提拔重用的前奏。
天启七年（1627年），洪承畴提任正三品的升陕西督粮道参政，从此在三秦大地一待十二年。
崇祯二年夏，王左挂、苗美率农民军攻打耀州。当时耀州并没有兵备道或总兵参将等组织反击附，人心涣散，岌岌可危。洪承畴自告奋勇，率领以民团为主的混合部队万余人出战，居然把王左挂击败，围困在泾阳县的云阳。王左挂最后还是乘着雷雨之夜才突围而走。洪承畴顿时名声大噪。
洪承畴是督粮道参政，他的主要职责是负责粮食工作，并不管理兵马，而平灭农民军有专门的兵备道负责。和农民军作战，洪承畴可谓越厨代庖，但在当时人人视剿灭民军为畏途，不是本专业的洪承畴却迎难而上而且战而胜之，显示出过人的胆略和智谋。
耀州解围后，三边总督杨鹤听说督粮道参政洪承畴居然率领民团打退王左挂，很是高兴，亲自召见了洪承畴，大加褒奖。
一阵交谈，杨鹤发现洪参政见识不凡，满怀韬略，是当今难得的人才，决定要大力栽培他。就这样，洪承畴加入进了镇压农民军的第一线。
崇祯三年六月，经杨鹤保举洪承畴升任延绥巡抚，成了封疆大吏。
延绥是陕西受灾最重，自然条件最恶劣，人民最穷、驻军最多的地区，相应也是各种社会矛盾最复杂尖锐的地区，是明末农民大起义的发源地和重灾区， 高迎祥、李自成、张献忠都是延绥人氏。
延绥巡抚也是一个凶险的职位，天启七年到崇祯三年，头尾四年就换了三位巡抚，从岳和声到张梦鲸再到洪承畴，
洪承畴中等个儿，身材瘦削，脸部瘦的两腮深陷，一副病容，两只三角眼常是半开半合。可就这么一个病夫却是让人闻言色变，心狠手辣斩杀农民军的屠伯。
杨鹤是洪承畴的伯乐，但对于如何平息民变，洪承畴和杨鹤的看法不同。
洪承畴认为以陕西目前受灾之重和农民军起义之广，如果要招抚，朝廷现有的财力根本解决不了流贼受抚后的安插善后问题，因此抚局在实际中绝对不可能成功。 “缓时治本，急时治标”，如今只能用强力将农民军镇压下去，待得社会秩序安定之后，再慢慢恢复生产、抚饥恤贫。
在此理念驱动之下，洪承畴向农民军挥起了屠刀。
洪承畴是文人，但有一套带兵驭将的办法，这也是他建功立业的资本所在，他的部队人数不多却极为凶悍。当了巡抚之后，军政大权在手，洪承畴指挥总兵杜文焕等四处搜剿农民军，所到之处，大开杀戒。
洪承畴生性冷酷，对待农民军更是毫不留情。他不像杨鹤一样能屈尊纡贵，赤心诚意，主动招抚，但也不拒绝农民军投降。只是投降之后的农民军必须无条件的接受他的调遣处置，稍有露出不满，就会被杀掉，甚而至于毫无反意，只要他觉得该杀就杀，生死只在他一念之间。
崇祯三年春，著名的农民军首领王左挂战败，投降了总兵杜文焕。八月，杜文焕发现王左挂不稳，似乎有叛变的苗头，向洪承畴请示如何办理。洪承畴二话不说，根本不做调查王左挂是否真的要叛变，很干脆的指示杜文焕将王左挂所部全部处决。八月，陕西巡按李应期和总兵杜文焕设计将王左挂以下九十八人全部杀害。
更令人发指的是崇祯四年四月，洪承畴授意守备贺人龙，摆下酒席假意招待投降的农民军。农民军好久没吃过这么丰盛的酒席，酒足饭饱，大快朵颐之后，憨厚淳朴的农民兄弟都去感谢洪抚院的盛情款待。一进大门伏兵四起，三百二十名降人全部沦为刀下之鬼。
杀降不祥，古有明训，白起长平坑杀赵军四十万，项羽新安坑杀秦军二十万，都留下千古恶名。熟读儒家经典，张口闭口仁义道德的洪承畴却对这些毫无顾忌。可能在他看来，只要当过一天流贼，就犯下了滔天之罪，无论用什么残忍的手段都不会受到良心和道义上的道谴责。