另一方面，山县有朋在京都无邻庵得知田村去世后，对黑龙会头目杉山茂丸说道：“日本的第一诸葛孔明是川上操六、第二是田村怡与造，这两位都不在了，不过我们还有第三孔明——儿玉源太郎，是时候让他发挥作用了。”

杉山表示儿玉从明治31年起就和他秘密研究对俄战争事宜，34年桂太郎内阁成立之际他就是重要的幕后策划者，36年四月由满州撤军问题开始研究对俄问题的解决策略，儿玉和他都参与了无邻庵会议，田村的去世正好是政府向参谋本部安插“明确指导人”的机会，以此安抚“好战”的部长们。杉山是情报通，对各方的态度都很清楚，他认为让对俄持强硬态度的儿玉担任参谋次长，可以作为战争指导的另一中心，所以同意山县的推荐。

山县随即写信给桂太郎，桂太郎与儿玉进行了商谈，儿玉同意接手次长职务。但儿玉已经是内相职位相当于副总理，如果再兼任参谋次长，那内阁这边的事情如何处理呢？

桂太郎拜托寺内正毅向大山岩征求意见，大山道：“要不我辞去总长一职？让山县来做总长，乃木希典做次长。毕竟桂首相需要儿玉这个内相，这样的话首相、总长、次长都是长州人，协调起来也容易。”寺内反对，因为山县身体不好，而乃木则担任着师团长的军职。桂太郎还是下决心让儿玉出任次长一职，为此他请山县进京与大山进行商议。之后他又亲自登门，终于说服了大山。

10月12日宣布桂太郎兼任内相，儿玉源太郎任台湾总督兼参谋次长。参谋本部的部长们对这个任命很满意。

天皇对此略有不安，10月13日，侍从长德大寺实则向寺内正毅询问有关任命儿玉为次长的情况，寺内回答说除了应对不测外儿玉还担负有改革参谋本部的重任。天皇虽已觉察到儿玉的出山是“战时人事”的安排，但仍然期望日俄交涉能和平解决。但现实事态并未按天皇希望的那样发展。

10月14日，小村向罗森递交了日方的修正案。修正案针对俄方“北纬39度以北中立化”的构想提出“鸭绿江两侧各50公里非武装地带”的方式，关于满州，除了承认清国主权和日俄两国权益外，还增加了一条，“相互约定，不阻碍今后韩国铁路与东清铁路在鸭绿江的对接。”罗森表示不会与清国以外的其它国家商讨任何有关满州的事情，所以拒绝了日本的修正案。

当天，海相山本权兵卫向各司令官、指挥官下达了指示：“向部队传达：近期不要听信谣言，保持谨慎态度，做好本职工作，努力加强技战术训练。”

这个时期，陆海军部最担心的是俄国获知日本加强战备的状况后抢先发难，山本的指示就是为了防止激进派过早泄露备战状态而发布的。当然战争的准备工作也得进行，10月16日，山本命令舞鹤镇守府司令东乡平八郞秘密进京，让他和常备舰队司令日高壮之丞交换职务。海军已经着手准备在常备舰队的基础上组建联合舰队了，新体制就得采用新人事，具有从萨英战争至日清战争丰富实战经验、熟知国际法的东乡很自然的被选中了。

儿玉上任后，除了继续推动战争计划的制定外，还拜访了伊藤博文和大山岩。两位元老被都看做是对俄谨慎派，儿玉向伊藤说明了日本军备不足的情况，这也是前任次长田村所忧心的事情；对于大山岩，儿玉请求他不要同时使用元老身份和总长身份，希望他专心于元老会议即可，大山虽不情愿，也只得答应。

晚上，儿玉在内相官邸宴请了参谋本部的部长们，希望他们能从大局出发，和陆海军紧密合作，并就陆军作战商议了一个基本方针：首先向韩国出兵，防止俄军南下，确保补给线，然后在满州与俄军决战。

10月20日，部长们再度集中商议，确定了两个作战方案，第一方案，一个师团（第12师团，附马队）在马山登陆，经由南路前往京城；第二方案，近卫师团、第2师团（或第10师团）、第12师团在仁川登陆，集结于黄州地区。为了方案能顺利实施，部长们制定了行动措施，特别是对于第一方案，从登陆到京城需要时间，所以提前派5个大队左右的有力部队潜入到京城附近，还暗中派遣一个物资征集队，前者成为临时先遣队，后者称先遣征集队，代号“丰富”、“蜂须贺”，并要求两组人马都着便装。

参谋本部和陆军部协同着手先遣队的准备工作，同时参谋本部的松石安治中佐被派往京城强化谍报工作。同一天，近卫、第1、5、10、11、12师团的兵站要员52人被召集至陆军大学参加特训班（11月2日结束），参谋本部第四部部长大岛健一为主任，藤井幸槌、西川虎次郎、陆大教官有田恕、蛎崎富三郎等任指挥官，特训内容除了兵站条例外还有朝鲜中路和南路兵站的设置、过往战役兵站实践、朝鲜水利与交通等。

第十章拖延的谈判（二）

10月26日，小村和罗森进行了第四次会谈，商讨日本修正案。罗森先陈述了个人意见，除了关于满州的条款，其余条款只要政府同意他没有意见，日方如果同意俄方提出的第五条（韩国部分领土非军事化、朝鲜海峡自由通行），俄方将考虑日本修正案。

彼得堡，库罗帕特金正在为日俄关系的前途担忧。10月19日，沙皇亲自主持的“远东特别委员会”正式成立，委员除了皇族以外，还有外交大臣拉姆斯道夫、财政大臣普莱斯科、内务大臣普列维、陆军大臣库罗帕特金、海军大臣奥维兰、远东总督阿列克谢耶夫和宫廷顾问别卓布拉佐夫，事务局长由通商航海港务厅次长阿巴萨担任。这个关于远东问题的最高决策机构中，除了他和拉姆斯道夫外都是别卓布拉佐夫一派的，他现在根本无法与之抗衡。库罗帕特金原本正在休假，得到委员的任命后，立即结束休假并上奏沙皇，希望在远东政策上采取慎重方针。他担心别卓布拉佐夫一派把持的远东特别委员会将会推进对日开战，10月28日，库罗帕特金再度上奏，强调俄军不要占领南满和接近韩国边境，以防止日本出兵韩国，对于已被命名为“尼古拉斯克”的龙岩里，也应即刻撤离，俄国应把力量集中在北满。其宗旨就是占领北满，无视撤军条约，避免与日发生冲突。

但库罗帕特金的建议毫无成效，也在他上奏当天，发生了一件大事——俄军重新占领奉天！

10月24日，驻奉天军政长官库尔钦斯基上校和两名陌生的俄军士官出现在街上，这两名士官隶属于驻扎在辽阳的东西伯利亚第15团，此行是为该团的两个步兵连和半个炮兵连进驻奉天打前站的。库尔钦斯基和马特里多夫都属于“别卓布拉佐夫一派”，是占领满州论者，他接到马特里多夫的通知要求协助部队移防。

库尔钦斯基到清国衙门交涉，提出因兵营尚未建设完成，撤退的部队需要进城过夜。奉天按条约规定第二阶段仍由俄军驻守，其后俄方未继续履行撤军约定，面对增兵要求，盛京将军增祺回复要向北京请示，但北京一直没有答复，库尔钦斯基也不催促。