穆斯林统治者并没有完全整顿埃及旧有的行政制度，而是保留和任用了大量的前政府基层行政人员，只是把身居高位的官员替换成了阿拉伯人指派的人选。由于对基督教徒的不信任，穆斯林政权严密监控着基层官员们的一举一动。当时，各地税收的收缴和分配都是靠埃及本地的科普特官员完成，政府则会派遣穆斯林官员巡视全国，以监督和视察税收工作的完成情况，并跟福斯塔特的中央政权保持定期的联络。同时，各地人民有义务为邮政人员和运输牲畜提供食品和饲料，以维持带有侦查功能的国有邮政系统正常运转。通过遍布全国的军事部署、税务巡查官和官方邮政系统，福斯塔特政权有效地控制着埃及全境。

从伊斯兰教征服初期的文献可以看出，穆斯林统治者们保留了希腊语和科普特语作为埃及官方的行政办公语言。而阿拉伯语在一开始，只是福斯塔特政权与其穆斯林下属之间交流的语言，但随着穆斯林税务巡查官和军队深入全国各地，它也作为一种书面语言开始流行开来。那一时期的纸草证实了，一些公共领域使用的文书如收据、公文、告示等都会由阿拉伯语和另外一种本土语言写成，这实际上是继承了拜占庭统治期间的双语传统。

从阿穆尔在占领埃及7年后开始的对基础设施的建设，我们也可以窥见穆斯林统治者对埃及行政管理的良好运转。为了从埃及运粮救济旱灾中的希贾兹，阿穆尔派人开凿了连通埃及盛产小麦的腹地和红海的运河，同时也疏浚了古代的法老运河，称为“信士们的长官的运河”（Khalij Amir al-Muminin），通过希利俄波利斯使巴比伦堡北边的尼罗河与红海的古勒助木相联系。]另外一项巨大的工程是，为了配合654年穆阿维叶对拜占庭的进攻，阿穆尔在亚历山大港建造了一支大型海军舰队。上述的浩大工程，均需要统治者对埃及本土可利用资源的深入了解和细致掌控，同时建设新的基础设施和修缮过去的设施也是统治者良好的行政运作手段和效率的体现。

2、宗教政策

穆斯林统治埃及后，在宗教上实行了“以夷制夷”政策和“迪米”制度，服务于他们在埃及建立稳定和有效统治的战略意图。

埃及当时的宗教环境相当复杂。在拜占庭统治期间，占埃及多数人口的科普特人信仰基督教“一性派”（Monophysite），而少数希腊罗马裔人口信仰拜占庭的官方教派基督教“二性派”(Melkite)，还有少部分的犹太教群体。当穆斯林进攻埃及时，受到拜占庭官方迫害的一性派基督徒都采取了不抵抗穆斯林甚至与他们合作的态度，加速了拜占庭帝国在埃及的统治的灭亡。

公元646年，穆斯林军队在阿穆尔�6�1本�6�1阿绥的率领下最终击退了拜占庭企图反攻埃及的军队，重新占领亚历山大。此时的埃及仍有大批希腊罗马裔居民并未随拜占庭军队撤走，他们中很多都曾经在拜占庭埃及政权中任职，且大多信仰与埃及土著居民不同的基督教“二性派”。

埃及的穆斯林统治者，把当时埃及所有的基督徒统称为“科普特人”。不过埃及的基督徒在穆斯林的统治下并不是团结一致的，而是把拜占庭时代的教派分歧延续到了伊斯兰时代。他们为了维护自身派别的利益，都采取了与统治者合作的态度，以确保敌对派别不会取得更高的政治地位。两派的代表人物通常会把自己与对手的分歧向穆斯林统治者申诉，以期后者能帮助自己打压对手。通常情况下穆斯林政权都会在一定时期偏袒一方，打压另一方，他们采取的手段有：集体流放和关押、教堂财产充公、高额税金或罚和关闭教堂。埃及基督徒之间分歧被穆斯林统治者充分利用，用以打击异教势力和稳固政权统治。

穆斯林统治者的宗教政策也体现在对科普特人改信伊斯兰教的态度上。他们延续在其他征服地区一贯执行的“迪米”制度。在伊斯兰国家中受到宽容和保护的基督徒、犹太教徒和祆教徒都被称为“迪米”（al-dhimma），即“立约之人”。这些非穆斯林必须承认伊斯兰教的崇高属性和伊斯兰国家的主导地位，并经由一些社会上的限制和缴付一种穆斯林不需缴纳的人头税（jizya），以表示他们接受臣属地位。相对地，他们享有生活和财产的安全，可接受保护免受外敌侵凌，可以自由崇祀，并在处理自身的事物方面，享有很高的自主权。

在伊斯兰初期，埃及的穆斯林统治者之所以没有在科普特人中强力推行伊斯兰教，经济因素是主要原因。作为穆斯林统治下的“迪米”人，必须缴纳人头税、土地税和服徭役。埃及大量基督教徒的存在无疑成为伊斯兰国家潜在的收入来源。

3、伊斯兰初期科普特人的生存状况

在四大哈里发和伍麦叶王朝统治时期，埃及是阿拉伯帝国版图内富庶的一个行省，科普特人作为顺民的地位在这期间没有变化。总的说来，统治者对科普特人还是较为宽容的，这也和阿拉伯帝国极盛时期海纳百川的气度有关。在大部分时间里，科普特人的宗教得到尊重，穆斯林法官也不会去干涉科普特人的案件，这期间也鲜有统治者因宗教问题而迫害科普特人的记录。因此在伊斯兰统治初期，埃及科普特基督徒的生活和穆斯林来临之前并没有很大的差别。除了在中央和各地方行政中心和军镇驻扎着大批的说阿语的穆斯林外，广大城镇和乡村人口仍以科普特基督徒为主。

上埃及杰梅镇（Jeme）的相关文献和建筑遗迹是证明穆斯林占领初期埃及基督徒生存状况的最好例证。这个小镇位于卢克索城附近，是附近村落和修道院的中心城镇。和从前一样，商业贸易和农业生产是这一地区基督徒主要的收入和生计来源，唯一的变化是他们需要承担穆斯林统治者强加的税收和徭役。除了税收收据和与税收相关的信件，其他由当地官员签发的公共合同和通行证件都表明基督教人群很大程度上是自治的。穆斯林总督和官员的名字通常只会出现在法律文件上，还有少量的商贸文本会提到阿拉伯名字。只有当出现如7世纪末8世纪初时基督教修道士群体拒绝缴纳税赋的时候，穆斯林统治者才会直接介入基督徒的生活。

4、科普特语的逐渐凋零

在穆斯林进入埃及之前，希腊语和科普特语是埃及的两种主要的语言。在穆斯林统治初期，希腊语继续作为埃及的行政和书面语言被使用，而科普特语则继续作为民间语言被基督徒们广泛使用。在穆斯林征服埃及后的几个世纪里，科普特语都一直是基督徒记录文档的专用语言。但是随着伊斯兰帝国统治的稳固，科普特语逐渐地被阿拉伯语取代。一是因为行政领域阿拉伯语的使用开始影响科普特人的日常生活，为了和穆斯林官员打交道和在政权中谋得职务，科普特人在不放弃母语的同时也必须学习阿拉伯语。705年后，阿拉伯语成为埃及的唯一官方语言，科普特语在公共场合的使用被大大减少，这也加速了科普特语的凋零。二是文化交流要求科普特人学习阿拉伯语。伊斯兰帝国东方的兴盛的文化使阿拉伯语成为了解当时世界上先进科学与文明的语言，同时阿拉伯语也成为科普特人与其他地区同样处在穆斯林统治下的基督徒相互联络不二选择。与拉丁语相似，科普特语在失去活力之后，继续在教会仪式中作为宗教语言得以保留。

5、科普特宗教机构