被天皇骂了也不打紧，出来之后擦干眼泪领着陆军继续干。但无论板垣征四郎如何强硬地主张缔结同盟，海军大臣米内光政海军大将均义无反顾地坚决反对。在内阁会议上，双方争论高达74次之多，几乎到了无会不吵的地步。
在整个太平洋战争期间，曾经有八个日本人登上过美国《时代周刊》的封面，这八人毫不例外都是日本陆、海军的大将。其中陆军三人，海军五人。米内光政就是海军五人中之一。《时代周刊》在描述米内光政时这样说:他的外号是“白象”，指他的身材高大，肤色异常白皙，颇显高贵，头发又黑又亮，就像胶片唱片。看起来刚毅而睿智。从敌人那里获得的是赞誉，反而在自己人眼里不值一文。作为对立面，日本陆军送给米内的外号是“金鱼大臣”，也就是华丽好看而不中用。
米内是一个讷于言而敏于行的人。尽管属于海军将领出身，但米内在国际事务方面有着不同寻常的开阔视野，他懂得日本的利益取决于能否和英美这样的海洋大国合作。作为加藤友三郎的忠实信徒，他决心誓死捍卫前辈“大加藤”不与英美开战的主张。幸运的是，他得到了海军次官山本五十六海军中将不遗余力的支持，他们的同盟军还有海军军务局局长井上成美。
相比于米内的英华内敛，海军次官山本五十六有着巨大的热情却深藏不露，他以敏锐的智力、灵活的思维和开阔的视野著称。山本是一个富有魅力、充满活力的领导者，其个性在日本海军中极为罕见。他擅长行政并深谙政治，工作大胆而富于创造力。有人说，山本的头脑像“剃刀一样犀利”，在原则问题上从不妥协。美国太平洋舰队情报官莱顿少校（此君在今后珍珠港、中途岛以及猎杀山本几节中都还要出场）在山本出任日本驻美国使馆武官期间与其有着不错的私交，他在给太平洋舰队司令官金梅尔海军上将介绍山本时说，“他是一个受过完整基础训练的杰出军官，比日军统帅部里的任何其他军官都更有头脑”。
山本反对三国同盟的原因很明确：德国的目标是建立世界新秩序，和德国结盟就意味着与旧秩序的守护者英美等国作战。鉴于当时日本海军的状况特别是海军航空兵的实际情况，综合日本与美国在国力上的巨大差距，日本不可能在以美国为对手的战争和造舰竞争中取胜，也绝对没有必要去为德国人火中取栗。早在1937年7月1日，山本就对米内说，“三国同盟是一个令我们国家命运岌岌可危的问题”。
米内非常信任山本。他们两个人早在海军炮术学校的时候就吃住在一起，业余时间经常在一起切磋剑道，锻炼身体。那时候他们还仅仅是海军的最底层军官，米内是海军大尉，山本是海军中尉。他们彼此了解对方并建立起深厚的个人友谊，这也是山本战死之后米内出任山本国葬委员会主任的主要原因。甚至在山本战死前一天的1943年4月17日，一直惶恐不安最后才入睡的米内甚至神奇地梦到山本来向他辞行。
作为海军大臣，米内经常放手让山本去工作，自己更多的时间是钻在屋里看书。米内经常对人说，“有山本这样一个次官，工作实在是轻松呀。”每次开会回来米内首先要做的第一件事就是把山本叫来，像下属向领导“汇报”工作一样地把会议的内容原原本本地告诉山本，然后两人共同作出判断和决策。山本也会坦率但毫无恶意地指出米内的缺点。他曾经当着面开米内的玩笑，“大臣的头脑也许不那么精明，嘴也不善于言辞，但是却有宽大坦荡的胸怀，为人正直，办事公道。”尽管私下里不分彼此，无话不谈，但是在公开或者有人的场合山本非常尊重米内，他从不坐下而是站的笔直聆听米内的训示。当时担任海军省副官兼海军大臣秘书的松永敬介少佐曾经这样说：“如果说米内是斧子的话，那山本便是长矛。”
山本反对与英美作战的思想在“帕内”号事件中表现的尤为明显。1937年12月12日中午13:00，就在南京即将沦陷之际，美国炮艇“帕内”号载着美国驻华使馆的最后一批人员和一些西方记者，拖着美孚石油公司的三艘驳船准备撤离烈焰四起的南京城。恰在此时，他们遭到了日本海军航空兵一个轰炸机中队的猛烈进攻。日军飞行员根本不顾炮舰上插着美国的国旗，直接对四艘船进行了轰炸。“帕内”号重伤被迫弃舰，两名美国水手和一名意大利记者丧生，包括舰长在内的48人受伤。此外，日军还攻击了英国炮舰“瓢虫”号并导致该舰起火。
“帕内”号事件彻底激怒了美国人。美国国内的鹰派人士甚至建议罗斯福总统立即向日本和中国水域派出足够的海军舰只，进行武力干预。美国驻日本大使馆的格鲁大使向当时的日本外务大臣广田弘毅递交了抗议书，甚至收拾好了准备离开的行李。为了避免事件升级，除了外交上进行斡旋道歉之外，日本海军也采取了一系列紧急攻关措施。一贯主张对美妥协的山本五十六，——当时的日本海军省次官对外发表声明，“这次事件的责任完全在日本，日本海军对此诚恳认错。”同时下令将直接责任者海军第二舰队航空队司令三并贞三少将撤职查办。山本亲自赶到美国驻日使馆找到了格鲁大使，眼含热泪地进行了真诚的解释和道歉，奉上了一张2214007.36美元的赔款支票。——这笔钱在当时足足可以造200架飞机。山本的诚意打动了美国人，加上美国当时也真没有和日本开战的准备，国内的孤立主义势力也不赞成美国介入战争，此事才没有酿成更大的冲突，最后不了了之。一直对此事高度关注的蒋介石大失所望。
米内和山本还有一个同盟军，他便是海军省军务局局长井上成美。井上是一个才华横溢有着钢铁般意志的人，自我标榜为“激进的自由主义者”，和山本和米内一样，井上同样在原则问题上立场坚定、从不屈服。在日本海军中曾经有这样的戏言。“又打败仗了吗？肯定是第四舰队吧？哦，果真是第四舰队呀！”这个善打败仗第四舰队的司令官就是有“日本海军最后一个大将”之称的井上成美。