郅支单于被汉朝剿灭后，康居在中亚的势力范围并没有受到影响，反而势力大增。汉成帝年间，康居国成了乌孙小昆弥的庇护地。当时，小昆弥子拊的弟弟日贰杀兄篡位后，因恐汉朝讨伐而逃往康居避难。公元前11年（元延二年），乌孙小昆弥末振将曾率八万余众北附康居，想借康居兵兼并大小两昆弥。
到公元91年（永元九年）后，北匈奴被东汉击溃，而且鲜卑人在蒙古高原崛起，北匈奴又西迁康居，与郅支单于的残部会合。在北匈奴西迁浪潮的冲击下，康居被迫南迁到索格狄亚那地区，故而以后的汉文史料中往往将康居、粟特并称，并说康国为“康居之后”。北匈奴大规模西迁乌孙、康居是在公元二世纪中期。在康居南迁时，也有一部分匈奴人随着而来。这个时期，康居国北部的领土大为缩小，锡尔河以北地区被西迁的匈奴人占据。
班超平定西域各国叛乱期间，康居国对班超和东汉政权有过帮助，也有过阻挠。那时，班超率疏勒、于阗、纡弥等国兵一万余人攻破龟兹国姑墨石城。此时的康居、月氏、乌孙等国都有归附汉朝的愿望，想帮助班超并力攻灭龟兹，打通与汉朝往来的通道。后来，莎车王勾结疏勒王反叛汉朝，康居王曾派兵援助疏勒王，导致班超久攻不下。这个时期的康居和贵霜刚刚和亲结盟，班超派使者给月氏王送去厚礼，通过月氏王向康居王劝谕，康居退兵，并将疏勒王押到月氏，转送汉朝。三年后，疏勒王又向康居借兵打回来，占据一些地方，并与龟兹国密谋诈降，被班超识破诡计，遂将疏勒王处斩。此后，康居与汉朝之间相安无事。
东汉时期，康居国的强大时间并不太长，基本上在班超出使西域前后。康居国的强大比起同时期的贵霜帝国来要略逊一筹。
公元三世纪时，贵霜帝国开始衰落，沦为波斯萨珊王朝的控制之下，贵霜帝国在印度的领土也逐渐缩小。
公元265～274年（晋武帝泰始年间），康居十分弱小，康居王遣使到晋朝献马，希望与新崛起的西晋王朝结交。
公元三世纪后，康居国已没有清晰的国界，史书中对康居自三国时就已称其为“粟弋”，专指当地居民的种类和地名了。
南北朝时期，嚈哒势力崛起，康居相对衰弱。嚈哒人西迁后，康居国就不复存在了。
史书上说，康居国姓温，本是月氏人，“旧居祁连山北昭武城，故康居左右诸国并以昭武为姓，示不忘本也”。这就是月氏人被从河西走廊驱逐出来的事实。康居国又称“悉万斤”，即撒马尔罕，出于索格狄亚那的中心地区。在贵霜帝国强盛期，当地的月氏人很可能被委任为征服地的城长。这些地区的统治者大部分都是昭武族的大月氏人。由于贵霜帝国的逐渐衰落，各地便分裂为许多小国。
公元357～367年间，由于柔然的崛起并争夺西域，嚈哒匈奴人又潮水般地涌入中亚阿姆河与锡尔河之间地区，攻灭粟特、政府索格狄亚那就显得轻而易举。到公元四世纪20年代，嚈哒匈奴人又南攻灭贵霜，从而成为中亚的强国，居于中国和波斯萨珊之间，这时的康居、安息、乌孙、花剌子模、罽宾、大宛等等汉代国家名称全都不见了。原来居住在中亚地区的匈奴人、康居人、乌孙人、月氏人逐渐融合同化。随着突厥人的涌入和突厥语的广泛流行，中亚各族都以作为各个因子被突厥这个庞杂部族所涵盖。中亚各国的昭武族人在臣属西突厥的前提下，保持了自己各地的小政权和民族根源，形成所谓的“昭武九姓”诸国。
在康居国近五百年的历史上，没有一个很有建树的君王，甚至没有留下一个君王的名字。从西汉初期役属西迁的大月氏人，后来又受西迁的匈奴人蹂躏，最后臣服于西迁的嚈哒。即使康居国历史上最强盛的时期，也得看月氏王的脸色行事。这些曾经割下古波斯王居鲁士头颅、也曾令波斯王大流士远征惨败、令亚历山大被迫穿上中亚服饰采用怀柔政策的中亚游牧人，在来自东方的的游牧人面前似乎都不堪一击，而且甘于臣服。康居人的政治才干甚至连昭武九姓都不如，其中的底蕴耐人寻味。
华严之祖，康居法藏
华严宗是唐初继法相宗之后成立的又一佛教宗派。它以《华严经》为宗经，主要发挥“法界缘起”的意旨。
华严宗的起源可以追溯到南北朝时北方的地论学者和南方的三论学者，华严宗人自称的学统传承关系则以隋唐之际的法顺为本宗初祖，唐初的智俨为二祖，法藏为三祖。其实，法顺和智俨只是华严宗的先驱者，法顺基本上是一位禅僧，曾劝人读《华严经》，相传作有《华严五教止观》，在其止观法门中把《华严》摆在最高的圆教的地位；他的弟子智俨著述较多，大力阐述《华严》思想，并提出了“十玄门”这一华严宗思想的重要方面，但是华严宗思想的核心是由法藏阐明的；华严宗的判教学说也是法藏提出的；在全国各地建立华严寺院，并普遍缔结宗奉《华严》的香社，也是由法藏推动促成的。所以，华严宗的实际创始人是法藏。
法藏俗姓康，祖籍西域康居，祖先世代是康居国相，祖父迁来长安定居，从此入籍中国长安。所以说，法藏原本是康居人。
法藏生于公元643年（唐太宗贞观十七年），17岁时皈依佛教，曾入太白山（在陕西郿县南）修行，学习佛经，回京后从云华寺华严大师智俨听讲《华严经》，前后9年。深受智俨赏识。公元668年（总章元年）智俨临终时，曾嘱门徒提携法藏，认为他专心钻研《华严经》，是绍隆遗法的希望所在。两年后，武则天的生母杨氏去世，武则天将母亲的府邸改为太原寺，下诏剃度僧人。经过道成、薄尘推荐，法藏获准剃度，在太原寺出家。
此时，法藏只受了沙弥戒，在公元674年（上元元年）奉诏在太原寺讲《华严经》。后来，又在云华寺开讲。皇上下旨命京城十大德为法藏授具足戒，并把《华严经》中贤首菩萨的名字赐给他作称号，称为贤首国师。自此以后，法藏经常参加翻译、广事讲说和著述，大振华严的宗风。
公元680年（高宗永隆元年），中印度沙门地婆诃罗来到长安，法藏往问西方的古德有没有关于佛一代教法的判释。据地婆诃罗说：印度那烂陀寺同时有两大论师，一位是戒贤，远承弥勒、无著，近继护法、难陀，依《深密》等经、《瑜伽》等论，立有、空、中三时教判；另一位是智光，远承文殊、龙树，近禀提婆、清辨，依《般若》等经、《中观》等论，立心境俱有、境空心有、心境俱空三时教判。地婆诃罗从印度带来的梵本中，有《入法界品》，法藏遂亲自和他对校，果然获得“善财求天主光等十善知识”和“文殊伸手按善财顶”两段，立即请地婆诃罗在西太原寺译出，这就是《大方广佛华严经（续）入法界品》。此后，法藏又奉诏和地婆诃罗及道成、薄尘等同译《密严》、《显识》等经论十余部，合共20卷。
公元690年（武后天授二年），于阗沙门提云般若在魏国东寺译经，法藏也列席译场。提云般若译出《大乘法界无差别论》，法藏特为该书作疏，发挥新义。
公元695年（证圣元年），于阗沙门实叉难陀在洛阳大遍空寺重新翻译《华严经》，法藏奉诏笔受，后来补入日照法师所译两段。