当时，于成龙身边没有亲人，也没有操办丧事的银钱。江宁知府小于成龙深受老总督厚恩，此时便责无旁贷，主动承担起了一切治丧事务，买来寿衣棺木，将老总督装殓起来，同时发快信通知远在山西永宁的于廷翼。

江宁百姓，除了到总督署吊唁祭奠之外，还专门采取了“罢市”的形式，表示对老总督的哀悼之情。有许多百姓，还在自己家里设了总督的灵位，挂了总督的画像，过年过节时上一份供品，焚香顶礼，聊表哀恋之情。这种民间的纪念，一直持续了许多年。

康熙二十三年七月，于廷翼带家人赶到了江宁，他看见百姓们用焚化纸钱的方式祭奠于成龙，便劝告说：“家父生平不爱钱票，请勿强加于他，往后祭祀莫用纸票。”

于成龙的灵柩启运回乡时，江宁知府于成龙及门下诸生、士民数万人，步行相送二十余里，一路哭声震天，如丧考妣。

于成龙的灵柩回乡后，被安葬在方山县峪口乡横泉村。

民间有传说，于成龙被奸臣所害，身首异处，康熙皇帝给于成龙平反后赐予金头。于家人为防金头被盗，一日之内出灵六十八次，真墓假墓共六十八处。这个故事当然是荒诞不经的，但后世仍然有人打这个“金头”的主意，于成龙的坟墓在新中国成立前夕曾经被村民发掘，后来又被夷为平地，至今也没有得到恢复。据知情的村民讲，于氏家族厚葬了于成龙，坟墓中随葬财物甚多，当时发掘的贫穷村民颇受其益。

十四、隆重、长久、深远的纪念

于成龙去世的消息传到北京，康熙皇帝十分伤感。他让大臣们商议于成龙的身后待遇，大臣们回奏，于成龙曾经受到降五级留任的处分，按惯例是享受不到太高规格的。皇帝说，撤销处分，恢复原来的级别，按从一品大臣的待遇，举行祭葬典礼，并且赐谥号为“清端”。“清”是指清廉，“端”是指正直。封建时代官员的谥号最高的是“文正”或者“文”，于成龙没有考上进士，没有进入翰林院，和这个“文”字无缘了，但“清端”仍是美谥，能够概括于成龙一生的成绩和风范。

康熙皇帝为人是比较厚道的，他恢复于成龙的品级，赐予祭葬和谥号，只是想展示自己“宽仁”的一面。其实，他听多了谗言，对于成龙在两江的行为还是有些疑虑的。七月份，内阁学士锡住从南方出差回来，入宫觐见，康熙皇帝忍不住又问了：“你从江南路过，有没有打听到原任两江总督于成龙各方面的情况？”锡住可能事先得到过别人的嘱咐，还是按统一口径来答复皇上：“于成龙确实比较清廉，但因为过于轻信，有时候会受到属下官员的欺骗。”

康熙若有所思地说：“于成龙在直隶干得很好，所以我才特别提拔他担任两江总督。他到江南上任后，就有人给我汇报，说于成龙作风大变，不再清廉了。病故之后，大家才知道于成龙一贫如洗，始终是廉洁的。大概是因为他脾气耿直，得罪了一些人，遭到人家陷害，说他是被属下欺骗。这都是不肖之徒的嫉妒，做官像于成龙这样的，全国能有几个？”笔者认为，于成龙在两江采取的新措施很多，各省官员执行不力，欺骗总督的情况应该也是存在的，只是这些不能算做是于成龙的过失，就连康熙皇帝自己，也是经常会被臣下们蒙蔽欺骗的。

这年冬天，康熙皇帝第一次南巡。南巡的任务很多，其中就包括考察江南，顺便也考察考察已故总督于成龙。十一月，康熙皇帝到了江宁，实地考察了一番，这才对于成龙彻底地放心，彻底地佩服，知道自己确实没有看错人，没有用错人。他十分感慨地对江宁知府小于成龙说：“你一定要学习前任总督于成龙的正直洁清，才不会辜负朕的一番眷顾提拔。”

南巡结束回到北京后，康熙皇帝便开始放心大胆地表彰于成龙，他下诏给大学士等官员，说：“国家澄叙官方，首重廉吏，其治行最著者，尤当优加异数，以示褒扬。原任江南江西总督于成龙操守端严，始终如一。朕巡幸江南，延访吏治，博采舆评，咸称居官清正，实天下廉吏第一。应从优褒恤，为大小臣工劝，其详议以闻。”

接着，康熙皇帝又亲自写诗表扬于成龙，诗句有：“服官敦廉隅，抗志贵孤洁。”“江上见甘棠，遗爱与人说。”

明珠等人当时还呆在朝廷，掌握重权，进谗诬告了几回，一点效果也没有，皇帝越发地推崇于成龙。好在于成龙已经去世了，恩怨也一笔勾销。大臣们经过商议，建议给于成龙追封“太子太保”的官职，并荫一子入监。康熙朱笔批示：“依议！”

“太子太保”名义上是东宫太子的老师之一，从一品衔。但清代已变成荣誉职位，并没有太子可教。而且，这个官职和“太子太师”“太子太傅”等官职，经常是用于死后追封的。“荫一子入监”就是所谓的“官荫生”，允许子孙一人，到国子监读书，几年后就可以做官了，这个待遇可能是让于成龙的孙子于准享受了。

康熙二十四年（1685）二月十五日，康熙皇帝给于成龙撰写了一篇碑文，全文如下：

朕读周官六计廉吏，曰廉善、廉能、廉敬、廉正、廉法、廉辨，吏道厥唯廉重哉！朕用是审观臣僚，有真能廉者，则委以重寄，赐以殊恩，所以示人臣之标准也。尔于成龙，秉心朴直，莅事忠勤，而考其生平，廉于尤善，以故累加特擢，皆朕亲裁。盖拔自庶官之中，洊受节钺之任，尔能坚守夙操，无间初终。古人脱粟布被，或者嫌于矫伪，尔所谓廉，本于至诚。闻尔之风，可以兴起。乃本懸牛鲅裳偈拧Ｈ照哂蟹讲炖簦霞敖恚煞缫ビ诓菀埃缆贰Ｋ记宓略谌耍诮癫汇Ｎǘ煜滤ｋ薷┖嫌咔椋匕⒔冢瓤济笔担衷磺宥耍峒酪岳瘛Ｓ纸缰龋陀栌屑樱餍舳印Ｎ睾簦顺夹屑骸⒎佟⑹轮髦溃晌接惺加凶湔咭樱瞬豢梢苑缡酪玻。甲浴短煜碌谝涣粲诔闪罚屑湟捎腥甭┳帧＃�

康熙二十四年四月二十六日，康熙皇帝又撰写了两篇祭文，命令汾州知府张奇抱，到于成龙墓前隆重宣读。祭文回忆了于成龙的生平事迹，对他的清廉与勤政再次大加赞叹，对于成龙的去世，再次表示哀悼。

康熙三十九年，于成龙的长子于廷翼病故，其子于准时任浙江按察使，“丁忧”回乡。四十二年九月，于准服孝期满，到北京补官，康熙皇帝特别召见了于准，很兴奋地指着于准对大臣们说：“这就是老总督的孙子啊！”随后，任命于准为四川布政使。这年十月，康熙皇帝西巡到太原，又把于准召来见面，询问于成龙墓地的道路远近，于准回答说有二百七十多里。皇帝国事繁忙，便打消了亲自祭墓的想法，只郑重题写了一块“高行清粹”匾额，派人送到了永宁于家。

康熙四十六年，康熙皇帝又一次南巡，见很多江宁百姓仍然在纪念老总督于成龙，民间还在流传于成龙的各种故事，不由地感慨万分，题写了一副对联：“历仕甘棠随地转，两江清节至今传。”