上师的恩德远不止上述的那些，以前，在释迦牟尼佛还是菩萨的时候，他作乞林嘎哩达王时，为了听一个偈颂法，他的身体被钉上一千枚铁钉：当他受生为嘎那夏瓦王时，为了听法，他的身上竖有一千支灯烛；他也曾为法而跳入火坑：当他受生为妙色工时，为了听法，他剥皮作纸、拆骨头作笔。阿底峡尊者也一样，他为了菩提心的教授，不怕风暴、怪鱼等的危险，在大海中漂浮十三个月，忍受众苦去找金洲大师。玛尔巴、密勒日巴等祖师也是为了求法的缘故，历经艰辛。以前去印度的道路不像现在有车有飞机的，那时候特别难走的，但是那些译师仍然舍生忘死的前去求法。他们都以黄金曼茶罗供养上师，作为传法的报酬，当他们事后回忆起路途的艰辛时，往往身体都在发抖，还有汉地的玄奘大师当年去印度取经的时候也是一去千万里，来回十几年。我们现在求法不需要受一点苦，上师便为我们开示完整圆满的道法，即使是诸佛亲临也不会有超过这个的教导了。由此可见，上师的恩德真是高如日月!阿底峡尊者曾说：“你们现在不需要受苦，就能听到这样的深法，福报很大，所以你们应该认真地听法!”还有谁的恩德比上师更大呢?《甘露藏》中说：“等同一偈字数劫，供养亦难报师恩；遑论开示全圆道，如定恩德谁能量?”又如：“如人羁狱受大苦，某人出资赎出狱，今住受用圆满处，当称彼为大恩人。是故诸师于我等，开示解脱恶趣法，暂今随欲而受用，人天富乐施大恩。次善开示无上法，能灭轮回诸衰损，导往三身妙果位，此等恩德何不大?”
第三、加持心相续恩。不但上师给我们讲法的恩德极大，给予我们心加持的恩德也是极大。我们心中所生的一切证德，都是通过祈祷上师加持我们心相续后所产生的结果，如果我们以上师瑜伽作为道之生命的话，我们将取得极大的修道进步，这也是因为上师加持的关系。《无尽藏窍诀歌》云：“呜呼空行之密语，能示诸法为一义，即是犹如天鹅喙，殊胜至尊之上师，当以净心敬顶戴。能诠心性唯上师，所诠法器即弟子，证悟此义刹那间，摧毁诸苦源师恩，现见实义为报恩，当恒视师为药王。深广轮回大海中，能渡宝舟唯上师，依此大船得大乐，真敬大力舟子师。以如日之智慧光，能遣无明殊胜士，如点金剂法成乐，恒依善巧轮王师。以如河心压二执，未舍一切具净智，未改自心住本地，皆由师言甘露生。心与心所诸名言，假立此法成助缘，源于胜师之语莲，即皆来自善知识。谁亦不知续隐义，名言以及诸佛密，窍诀眼见享法味，礼师足尘证智慧。空箭射中诸实法，以现方便证空性，以智慧见所量现，彼慧源于无上师。方便令惑转道用，任何妄念无法转，由此窍诀藏所生，定依至尊力获得，故以方便恒依止，具有传承加持师。”
上师加持其弟子心相续的事例很多，例如：当谛洛巴将泥曼茶罗扔在那若巴脸上时，那若巴顿时生起三摩地达七日之久。大持明吉美林巴曾在梅朵桑钦普的大密洞内闭关三年。尤其是在拜读隆钦巴尊者的著作典籍之后，他了解到尊者乃是与真佛无二的化现，因而从内心对尊者产生极大的信心。于是，他精进修持上师相应法，因而得到莲花生大士和隆钦巴尊者二位智慧身的摄受，在净相中亲见隆钦巴尊者如见佛陀，而不是现凡夫俗子相。虽然他与尊者所处的时代，前后相差将近三百年，然而因为对尊者毫无怀疑的虔诚心，使他得以在禅定定中，获得尊者三次亲自授予法要，与尊者成为师徒。尊者授与他诸多殊胜教法，有如瓶中之甘露，点滴不漏地倒入另一瓶中，使他如同得到父亲财富之人，成为尊者传承的持有者，证悟境界与上师无所差别。以此因缘，他解除了喉部报身轮的脉结，从心中涌现如大海般的意伏藏，唱出了表达证悟境界的原始金刚道歌。
第一次面见上师的缘起，是在精修经义的光明净相中，他见到未来佛--须弥山燃灯宝幢佛之剎土。在此以具备光明六界人身的光明城中，祥瑞遍知自在的隆钦巴尊者显现身相庄严，穿著三种袈裟，形貌俊美成熟。他亲睹上师的幻化身如彩虹，虽清晰明现，但却不是可触摸的实体，毫无疑虑地深信上师与佛无二。上师说：“愿所詮内容融入汝心；愿能詮之传承得圆满”得此授记，使他心中生起无比的信心和敬重。这是上师显现身形对他的身加持。
第二次于净相中见隆钦巴尊者时，上师赐予他一卷经书说：“此书详细记载了金刚乘隐妙之教授。”这时便传了《大密藏相应解法》。上师说：“此乃汝之身世预言。”说完，又赐予一卷纸条。他打开一看，上面写有两行字跡，上行写著：“汝之前世乃遍知法王”，正当他准备阅读其他文字时，那些原本清晰的字迹和上师的形貌，却像云雾般消失不见，而他连上师的身相和面容都还来不及细看。这是上师对他的语加持，喻示允许他取出伏藏，编写典籍。
几个月之后，他第三次拜见了以班智达装束出现的隆钦巴大师。上师微笑著，像个二十几岁的年轻人，出现在金刚身坛城中。在坛城上方，装饰有两个奇异的牌坊，上面装饰着璎珞，这是自然天成。自性五种双运任运成就的标志。
此坛城就是心的本来面目，上师为他讲解其中密意，使他获得了光明清净大圆满的灌顶。这是上师的意加持，自此他成为尊者实传证悟法脉的持有者。在短时间内，他三次亲见上师，无漏地得到光明密义，即《大圆满》法的所有续、传承和诀窍。
又如，一天，全知麦彭仁波切去见上师蒋扬钦哲旺波仁波切，守门的喇嘛不让进，吵了起来，全知麦彭仁波切力气很大，随便把他们往两边一推，就闯进了上师的屋里。屋里蒋扬钦哲旺波仁波切拥着大氅坐着，头蒙在大氅里，全知麦彭仁波切这时见到上师一言不发，心里想可能是刚才与守门喇嘛吵闹让上师不高兴了，心里有些懊悔，正在如坐针毡，不知所措的时候，上师突然从大氅里伸出手来，抓住全知麦彭仁波切，大喊一声“阿喂！”，全知麦彭仁波切于是一观察心的本性，当下大悟。
还有一个公案，一天华智仁波切与弟子纽西喇嘛隆多一起在帐篷里进餐，华智仁波切突然指着桌上一个用糌粑、奶渣、酥油做成的圆状食物，问：“哪里是头，哪里是尾？”纽西喇嘛隆多知道这是上师在向自己解说心的本性，一观察心性，没有头，没有尾，便刹那证悟了。
还有汉地禅宗也有很多这样的故事，比如滴水禅师年轻时，在仪山禅师座下苦参(cān)，有一次请示道：“无字与般若有何分别？” “你这个傲慢的小辈！”吼声中，仪山一拳打去。并且将滴水赶出法堂。懊恼异常的滴水，回到僧堂，那关门的声音冲击到耳朵，豁然开悟，再而入室，报告无字与般若皆在一吼之声中，得到仪山禅师的印可。
不光是出世间胜果的成就，心里面有什么愿望难以成就的话，都可以祈请上师，这样的话心愿将会无碍的成就。对于敌人、强盗、水火、悬崖、野兽等等的畏惧如果诚心对上师祈请的话都会得到救护。无论息增怀诛任何事业祈祷上师没有不无碍成就的。所以作其他任何事业没有能比得上祈祷上师的。所有明咒当中最殊胜的就是祈祷上师，但是大多数人不知道这个功德，假如现在上师不在世了的话对它们祈祷也一样具有这样的功德。所以应该经常的祈祷。如密续云：“何人俱胝劫，修十万本尊，不如一刹那，忆念上师胜。”《誓言庄严续》云：“十万劫中勤观修，具相随好之本尊，不如刹那念师胜，念咒修法千万遍，不如祈师一遍胜。”
第四、以财物摄受为眷属恩。上师为了度化我们用尽了一切的办法，有很多的上师看见我们穷困就先给我们财物，让我们的心态转变到佛法上，恩德很大。不单是这一世给我们财富，我们生生世世的世间出世间的圆满都需要依靠上师，因为前世给我们受戒的恩德，所以现在我们能得到圆满的人身，因为前世教导我们布施的修法，并且成为了我们布施的对境，所以生生世世的福德不缺。所以如果好好观察的话，所有一切的自己的善根、功德、受用、身体等都是上师赐给的。所以他的恩德高过日月。如此这般的反复思维，这么大的恩德如何报答呢？无法报答。唯一能作的是把我的身、口、意三者供养给上师，从此时起直到正觉间都一直要供养您，您是我从现在起直到佛果间的部主。应该要这样诚心诚意的观想。