那有的人说了：上师应该是清净了所有过失，具足了所有功德的，但是我们的上师不是这样的，能看见他的很多过失，很多功德他都没有。他的脾气也不好，贪欲心也强，很吝啬，象这样具有很多的过失，为什么会这样呢？象这种分别念生起的时候是不用马上去强行压制他的，譬如，当我们准备洗去衣服上的污垢时，应该先让污垢显现出来；所以，我们也应该先让这种观察过失的心显现出来，然后再作这样的思维：不知道我所见的这种过失，上师是真的有还是假的有？象前面所说的一样，这未尝不是一种业感的幻相。胆病患者将白螺看成是黄色的；风病患者将雪山看成是蓝色的；坐船有船行木栘的感觉；有翳障的人，眼前好像毛发乱坠：连这么一点点暂时的幻觉都能造成这样的障碍，更何况我们长期以来完全被无量的业烦恼所蒙蔽呢?过失和功德仅仅是我们自己安立的而已，比如喜欢喝酒的学生，自然就喜欢示现喝酒的大瑜伽士。喜欢睡觉的弟于，往往会不满诵经到深夜的老师。我有几个弟子就都很喜欢抽烟，我给他们讲了很多抽烟的过患让他们戒烟，他们起先是勉强做到了，但是后来来了一个抽烟的上师，他们以为这个上师功德大，把抽烟都当成功德了，所以后来看见他们的时候，很多人都恢复了抽烟。我们还可以从另一个角度考虑，这些现象也可能是上师为了度化我们而故意示现的过失。如来也可以示现心怀嗔恚或悭吝，以及瞎子、疯子、犯戒等各种相。《父子相见经》中说：“有时现梵释，有时现魔相，饶益诸有情，世人难测度，女相女行止，亦在畜生道，无贪贪欲相，无畏畏惧相，无痴愚痴相，未疯疯狂相，非盲盲人相，诸种种化现，调伏诸众生。”《大涅槃经》、《金光明经》等许多经典中说过类似的问题，《观音菩萨普们品》中也说：应以何身得度者,即现何身而为说法。因为没看见上师是佛和看见上师的过失根本不能成立上师不是佛，上师确定唯是诸佛的化身，前面的三个科判中都讲过了，这时应该详细的思维一下，坚定不移的信解上师是一切诸佛的化现，这个定解一定要建立起来。
具体的修法是：先对自己最有信心的上师观为诸佛的总集化现，以这个见解为目的而作观察修。此时定解自然生起，当获得决定时，在决定的心态当中其他的什么也不想，唯一在这种定解的觉受中安住。当又生起了其他念头的时候，又来观察，当生起定解后再安住。这个就叫轮番修。这样反反复复的长时间修习后，当上师是佛，上师与佛无二无别的觉受自然生起的时候，这就是修法的验相已经显现了。对这个上师修成了以后，再对自己稍有法恩的善知识都观成是这个根本上师的化身。最后生起所有上师无别的觉受，而且如果对平常轻视的一位上师有所不敬的时候，心中特别的惧怕，如同对根本上师的畏惧感一样的话，就达到了依止上师验相成就的标准。
如此反复思维，当所有的上师都是佛的定解自骨髓中生起的时候，此时观察我自己的上师是什么佛的化身：诸佛是我上师化身的基础，上师是诸佛的化身，这就是化身上师。再深一步的观察的时候，上师也是报身金刚持佛的化身，所以金刚持佛就是上师。那金刚持佛是从哪里来的呢？他是从大乐法身中所显现的，所以自己上师的来源从究竟上来讲是诸佛的智慧大乐法身。《金刚经》中说：“若以色见我，以音声求我，是人行邪道，不能见如来。”诸佛的智慧是法界中无分别的智慧，这个就是上师的大乐法身显现成具有形象的如来金刚持，如来金刚持又显现成化身上师、善知识的形象。所以自己的上师是三身无二的唯一显像，所以自己的上师是三身总集的显像，这样来讲的话，自师为佛，佛也是自师。根据这个道理以此类推也可知道上师是所有本尊和所有空行的总集。如此可以推知上师就是所有三宝三根本的总集。《密集金刚续》《胜乐续》《大威德续》《时轮续》等四六续部的诸本尊和文武百尊等所有的诸佛，自己所知的一切佛菩萨本尊等，这些都是上师大乐法身的显现。报身上师是金刚持佛的化身，这一切都不能超越自己的根本上师。根本上师是这一切圣尊的根源，所以说遍及一切部，归纳为百部，百部归纳为五部，三部、三部归纳于大密一部上师金刚持中。这一切圣尊收摄即为上师金刚持尊，所以上师是一切圣尊的总集、作者、周遍者。在有的仪轨中说上师为“百部遍主”就是这个密义。所以说莲师、无垢光尊者，龙猛菩萨、宗大师等所有的上师总集就是自己的上师。所有四六续部本尊没有超越上师而独立存在的，上师就是所有本尊的总集，上师与一切诸佛无二无别，也是所有诸佛的总集，上师是金刚持佛，金刚持佛的五蕴是五部如来，四大是四佛母，上师的十二处，筋脉关节都是大菩萨众，肢体是愤怒本尊的自性。与这个是同样的，上师的蕴、界、处等也都是诸佛菩萨本尊等。所以上师是五部如来等佛，地藏、金刚手等僧，相续断证功德为法宝，故为三宝的总集。如续部云：“上师即佛亦即法，如是上师即僧众,一切能作乃上师,师为具德金刚持。”
上师的智、悲、能为三怙主，上师也是诸佛智、悲、能之三本体，所以圣三怙主也是上师的显现。如上所说而生起定解和感受的话，依止上师的定解就算达到究竟了，平常所说的和上师无二无别和达到上师的果位的意思为：自己成佛时，在大乐法身界中，上师的三密与自己的三门无二无别了，这就是所谓的上师相应。
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还是提醒，这里所谓的上师一定是大家今后自己经过反复勘验的具德上师，而不是随便的。这里不便拆开细讲细分析这些，但是其实是最重要的部分。里面从修法到验相等等也介绍得很清楚了，虽然平实平白，其实却是密中之密。